结论：员工请假两年不返岗，用人单位不能直接辞退，而需根据具体情况，遵循法定程序处理，否则可能构成违法解除劳动合同，需承担相应法律责任。以下从不同角度详细分析：
一、法律对员工请假及用人单位处理的规定
根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，员工因个人原因需要长期请假的，应与用人单位协商一致，并按照用人单位的规章制度办理请假手续。若员工未经批准擅自离岗，或请假期限届满后未返岗且未续假，用人单位不能直接辞退员工，而应先进行催告，要求员工返岗或说明情况。
二、用人单位可辞退员工的法定情形
员工严重违反用人单位规章制度：
- 若用人单位的规章制度中明确规定了员工长期请假不返岗的处理方式，如视为旷工、严重违反规章制度等，且该规章制度已经过民主程序制定并公示，员工也已知悉，那么在员工长期请假不返岗的情况下，用人单位可以依据规章制度辞退员工。
- 关键点：规章制度需合法有效，且员工需已知悉并同意遵守。
员工不能胜任工作，经过培训或调整工作岗位仍不能胜任：
- 此情形通常不适用于员工长期请假不返岗的情况，但若员工请假期间或返岗后表现出不能胜任工作的迹象，且经过培训或调整工作岗位后仍不能胜任，用人单位可以依据此条款辞退员工。
- 关键点：需证明员工不能胜任工作，且经过培训或调整岗位后仍无改善。
劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行：
- 若因员工长期请假不返岗导致用人单位生产经营发生严重困难，或劳动合同订立时所依据的客观情况（如岗位撤销、业务调整等）发生重大变化，致使劳动合同无法履行，且用人单位与员工协商未能就变更劳动合同内容达成协议，用人单位可以提前三十日以书面形式通知员工本人或额外支付员工一个月工资后，解除劳动合同。
- 关键点：需证明客观情况发生重大变化，且劳动合同无法履行，同时需履行协商程序。
三、用人单位直接辞退员工的法律后果
若用人单位在员工长期请假不返岗的情况下，未经催告、未依据规章制度或法定情形直接辞退员工，可能构成违法解除劳动合同。根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条，用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
四、建议处理流程
- 催告返岗：用人单位应首先向员工发出书面催告通知，要求其在规定期限内返岗或说明情况。
- 调查核实：了解员工请假原因及是否具备返岗条件，如员工因病需继续治疗，应要求其提供医疗证明。
- 依据规章制度处理：若员工无正当理由拒不返岗，且用人单位规章制度中有相关规定，可依据规章制度处理，如视为旷工、解除劳动合同等。
- 履行法定程序：在解除劳动合同前，应确保已履行法定程序，如通知工会、提前三十日书面通知员工等。
总结：员工请假两年不返岗，用人单位不能直接辞退，而应遵循法定程序，依据规章制度或法定情形处理。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。