在行政案件查处中，若部门规章被废止且有新规定出台，原则上应适用新规定，即便新规定较重也不能再适用老规定。以下从不同角度为你详细分析：

法律适用原则角度

根据“新法优于旧法”的法律适用基本原则，当新的部门规章出台并废止旧的部门规章时，在新的部门规章生效后，对于相关行政案件的查处应当适用新的部门规章。这是为了确保法律体系的与时俱进，使行政执法活动能够依据最新的、符合当前社会发展和政策导向的规范进行。例如，在环境保护领域，随着对环境质量要求的提高，新的环保部门规章可能会对污染物的排放标准、处罚力度等方面做出更严格的规定。当新规章生效后，环保部门在查处相关环境违法案件时，就必须依据新规章进行，而不能再适用旧规章中相对宽松的标准。

法律溯及力角度

一般情况下，法律、法规和规章不具有溯及既往的效力，即新法对其生效前发生的行为和事件不适用。但在行政案件查处中，如果新规章明确规定其具有溯及力，或者从立法的目的和意图来看，新规章应当适用于已经发生但尚未处理完毕的行政案件，那么在这种情况下，新规章就可以适用于相关案件。不过，这种溯及力的适用通常是比较谨慎的，需要有明确的法律依据和合理的理由。例如，某些涉及公共安全、社会秩序等重大利益的部门规章，为了及时纠正违法行为、维护社会稳定，可能会规定对其生效前一定期限内的违法行为也适用新规章进行查处。但即便如此，也需要在法律框架内进行，不能随意扩大溯及力的范围。

特殊情况考量

如果老规定在特定情况下对行政相对人更为有利，且新规定没有明确排除这种有利情形的适用，从保护行政相对人合法权益的角度出发，行政机关在查处案件时也可以适当考虑老规定中的有利条款。但这并不是普遍适用的原则，需要结合具体的案件情况和法律规定进行综合判断。例如，在某些行政处罚案件中，旧规章可能对某种违法行为的处罚幅度相对较轻，而新规章提高了处罚幅度。如果行政相对人的违法行为发生在新规章生效前，且新规章没有明确规定对其生效前的违法行为适用新处罚标准，行政机关在处罚时可以考虑旧规章中相对较轻的处罚幅度，但这需要行政机关在行使自由裁量权时进行充分的论证和说明。

实际操作建议

对于行政机关而言，在遇到部门规章废止并有新规定出台的情况时，应当及时组织执法人员学习新规定，准确理解和把握新规定的内容和要求，确保在行政案件查处中正确适用法律。同时，在作出行政处理决定时，应当向行政相对人充分说明适用的法律依据和理由，保障行政相对人的知情权和申辩权。对于行政相对人来说，如果认为行政机关在案件查处中适用的法律错误，可以通过行政复议或行政诉讼等法定途径维护自己的合法权益。

如果你在行政案件查处中遇到具体的法律问题，欢迎直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。