核心结论：用残疾证挂靠公司，中途公司未按合同挂满时间，违约金的计算需结合合同约定、实际损失、法律规定等多方面因素综合确定，以下分情况说明：

1. 合同有明确违约金条款
   • 若条款合法有效：如果双方签订的合同中明确约定了公司未按挂满时间履行时的违约金计算方式，比如按照未挂靠时间的比例支付一定金额的违约金，或者按照合同总金额的一定比例支付违约金等，且该条款不存在违反法律强制性规定、显失公平等情形，那么一般按照合同约定来计算违约金。例如合同约定若公司未挂满约定时间，需按照每月挂靠费用的一定倍数（如 2 倍）向您支付违约金，此时就可以依据此标准计算。
   • 若条款可能被调整：虽然合同有约定，但如果公司能证明该违约金过分高于您因公司违约所造成的实际损失，公司可以请求法院或者仲裁机构予以适当减少。反之，如果您能证明实际损失高于约定的违约金，您也可以请求增加违约金。比如合同约定违约金为 1 万元，但您能证明因公司违约导致您遭受了 2 万元的实际损失，您就可以请求增加违约金至 2 万元。
2. 合同没有明确违约金条款
   • 以实际损失为基础计算：当合同中没有约定违约金时，您可以要求公司赔偿因违约给您造成的实际损失。实际损失包括直接损失和间接损失。直接损失比如您原本预期通过挂靠残疾证获得的一定期限内的挂靠费用收入，若公司未挂满时间，这部分未获得的收入就是直接损失。间接损失则可能包括因公司违约导致您错过与其他公司合作挂靠的机会而遭受的损失等，但间接损失的证明难度相对较大，需要您提供充分的证据来支持。
   • 参考类似交易习惯或行业标准：在确定实际损失存在一定困难时，也可以参考同行业类似残疾证挂靠交易中，因一方违约给另一方造成损失的赔偿情况，以及当地的行业惯例等，来合理确定赔偿金额。不过这种方式相对缺乏明确的法律依据，更多是作为一种辅助参考。

温馨提示：残疾证挂靠公司这种行为本身可能存在一定的法律风险，因为这种挂靠行为可能涉及虚假申报、骗取相关优惠政策等违法情形。如果因此产生纠纷，在处理违约金问题的同时，也需要考虑这种行为可能带来的其他法律后果。如果您还有其他关于此类法律问题的疑问，欢迎随时向我咨询。