结论：双方同意签了协议要求对方离开自己的店，这一行为是否合理，需结合协议的具体内容、签订背景及双方的真实意图等多方面因素综合判断。以下从不同角度进行分析：
协议内容合法性角度：
- 如果协议内容明确、合法，且不违反法律法规的强制性规定，也不违背公序良俗，那么双方签订这样的协议是具有法律效力的。例如，协议中明确约定了对方在一定期限内离开店铺，并可能涉及一定的补偿或违约责任等条款，只要这些条款不违反法律，就是合理的。
- 如果协议内容存在违法或违背公序良俗的情况，如要求对方以不合理的低价离开店铺，或者包含其他不公平、不合理的条款，那么这样的协议可能是无效的，或者部分无效。
双方真实意图角度：
- 双方签订协议时，应基于真实、自愿的原则。如果双方都是出于自愿，且对协议内容有清晰的认识和理解，那么签订这样的协议是合理的。
- 如果一方是在被欺诈、胁迫或者重大误解的情况下签订的协议，那么这样的协议可能是可撤销的。在这种情况下，受损害方有权请求人民法院或者仲裁机构撤销该协议。
协议履行与违约责任角度：
- 协议签订后，双方应按照协议约定履行各自的义务。如果一方未按照协议约定履行义务，如拒绝离开店铺，那么另一方有权要求其承担违约责任，包括但不限于支付违约金、赔偿损失等。
- 同时，如果协议中约定了合理的解除条件或终止条件，当这些条件成就时，双方也有权解除或终止协议，并要求对方按照协议约定承担相应的责任。
法律建议：
- 在签订类似协议时，建议双方明确协议内容，包括但不限于离开店铺的时间、方式、补偿或违约责任等条款，以确保协议的合法性和有效性。
- 签订协议前，双方应充分了解协议内容，并确保是基于真实、自愿的原则签订的。如有必要，可以寻求专业律师的协助，对协议进行审查和修改。
- 如果协议签订后发生争议，双方应首先尝试通过协商解决。如果协商无果，可以寻求法律途径解决争议，如向人民法院提起诉讼或向仲裁机构申请仲裁。
可能法律后果：
- 如果协议合法有效，且双方均按照协议约定履行义务，那么一般不会产生法律后果。
- 如果一方未按照协议约定履行义务，可能会面临违约责任，包括支付违约金、赔偿损失等。
- 如果协议存在违法或违背公序良俗的情况，可能会被认定为无效或部分无效，双方可能需要承担相应的法律责任。
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