合作协议书中约定不让对方在附近开店，这一条款是否违法，需根据具体情况来判断。以下从不同角度为你详细分析：

1. 从合同自由原则的角度：

   • 合同自由原则是合同法的基本原则之一，它允许当事人在不违反法律、行政法规的强制性规定和公序良俗的前提下，自由约定合同内容。因此，如果合作协议书中的这一条款是双方真实意思的表示，且没有违反相关法律法规的强制性规定，那么该条款在合同内部是有效的，对双方具有约束力。

2. 从反不正当竞争法的角度：

   • 如果该条款的目的是为了限制对方在特定区域内的竞争，且这种限制超出了合理的范围，可能构成不正当竞争。根据《中华人民共和国反不正当竞争法》的相关规定，经营者不得采用财物或者其他手段进行贿赂以销售或者购买商品，也不得在帐外暗中给予对方单位或者个人回扣，同时不得妨碍其他经营者的合法经营活动。如果合作协议书中的条款被认定为妨碍了其他经营者的合法经营活动，那么该条款可能因违反反不正当竞争法而无效。不过，一般的限制开店条款，若未达到妨碍合法经营的程度，通常不直接受此法规制。

3. 从反垄断法的角度：

   • 如果合作双方在相关市场上具有支配地位，且该条款的目的是为了排除、限制竞争，那么该条款可能违反《中华人民共和国反垄断法》的相关规定。反垄断法禁止具有市场支配地位的经营者从事滥用市场支配地位的行为，包括没有正当理由，限定交易相对人只能与其进行交易或者只能与其指定的经营者进行交易等。但这种情况通常适用于大型企业或具有市场支配地位的主体，一般合作协议中的限制开店条款较少涉及。

4. 从合同效力的角度：

   • 即使该条款在合同内部有效，但如果其履行导致对方无法正常经营或造成重大损失，对方也可能依据《中华人民共和国民法典》中关于合同效力、违约责任等规定，主张该条款显失公平、违反公序良俗或构成违约等，从而要求变更或解除合同。

法律建议：

• 在签订合作协议书时，双方应充分协商，确保条款内容合法、合理，不违反相关法律法规的强制性规定。
• 如果条款涉及限制对方在特定区域内的经营，应明确限制的范围、期限和条件，以避免构成不正当竞争或违反反垄断法。
• 如果对方认为条款违法或显失公平，应及时通过协商、调解或诉讼等方式解决争议，以维护自身合法权益。

可能后果：

• 如果条款被认定为违法或无效，双方可能需要根据实际情况重新协商合同内容或解除合同。
• 如果因条款履行导致对方损失，违约方可能需要承担赔偿责任。

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