工厂让签合作协议书本身并不违法，但具体是否合法需根据协议内容及签订过程来判断。以下从不同角度为你详细分析：

1. 合作协议书的法律性质

合作协议书，本质上是一种合同，是双方或多方当事人之间设立、变更、终止民事关系的协议。只要协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方意思表示真实，那么这份合作协议书就是合法的，对双方都具有法律约束力。

1. 工厂让签合作协议书的合法性判断

   • 协议内容合法性：首先，要审查合作协议书的内容是否合法。比如，协议中不能有违反法律法规的条款，如要求员工承担不合理的责任、剥夺员工的合法权益等。如果协议内容存在违法之处，那么这份协议就是无效的，工厂让签这样的协议就是违法的。
   • 签订过程合法性：其次，要关注签订过程是否合法。工厂在让员工签订合作协议书时，必须确保员工是在自愿、平等、公平的基础上签订的，不能存在欺诈、胁迫等情形。如果工厂利用职权或优势地位强迫员工签订不公平的协议，那么这种行为就是违法的。

2. 可能存在的法律风险及建议

   • 法律风险：如果合作协议书的内容或签订过程存在违法之处，员工可能会面临权益受损的风险。比如，协议中可能规定了不合理的违约责任，导致员工在违约时需要承担过重的经济负担；或者协议中剥夺了员工的某些合法权益，如休息休假权、社会保险权等。
   • 建议：在签订合作协议书前，员工应仔细阅读协议内容，确保自己理解并同意其中的条款。如果对协议内容有疑问或不满，应及时与工厂沟通协商，寻求修改或补充。如果工厂拒绝修改或补充，且员工认为协议内容存在违法之处，那么员工可以拒绝签订，并向相关部门投诉或寻求法律援助。

3. 特殊情况下的合法性判断

   • 如果合作协议书实际上属于劳动合同：有时候，工厂可能会以合作协议书的名义与员工签订劳动合同，以规避劳动法律法规的约束。这种情况下，如果合作协议书实际上具备了劳动合同的主要条款（如工作内容、工作地点、工作时间、劳动报酬等），且双方实际履行了劳动合同的权利和义务，那么这份合作协议书就应当被视为劳动合同。工厂如果以此方式规避劳动法律法规的约束，就是违法的。
   • 如果合作协议书涉及特殊行业或领域：在某些特殊行业或领域（如金融、医疗等），合作协议书可能需要满足特定的法律要求或监管标准。如果工厂让签的合作协议书不符合这些要求或标准，那么也是违法的。

总结来说，工厂让签合作协议书本身并不违法，但具体是否合法需根据协议内容及签订过程来判断。如果你对合作协议书的内容或签订过程有疑问或不满，建议及时咨询专业律师或相关部门，以确保自己的合法权益不受侵害。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。