子公司管理发工资，通常不会改变原有的劳动关系，但具体还需根据实际情况来判断。以下从不同角度为你详细分析：
一、劳动关系的认定原则
劳动关系的认定，主要依据的是劳动者与用人单位之间是否存在事实上的劳动用工关系，包括劳动者是否接受用人单位的管理、指挥与监督，劳动者提供的劳动是否是用人单位业务的组成部分，以及用人单位是否向劳动者支付劳动报酬等因素。工资支付只是劳动关系中的一个方面，并非决定性因素。
二、子公司管理发工资的情况分析
如果子公司是独立法人：
- 子公司作为独立法人，具有独立的民事权利能力和民事行为能力。如果子公司直接招聘员工，并与员工签订劳动合同，那么员工与子公司之间就建立了劳动关系。此时，子公司向员工支付工资，是履行其作为用人单位的义务，不会改变员工与子公司之间的劳动关系。
- 如果员工原本是与母公司签订劳动合同，但被派驻到子公司工作，且工资由子公司代发，这种情况下，员工的劳动关系仍然属于母公司，子公司只是代为支付工资，并不改变原有的劳动关系。但需注意，这种安排需要母公司、子公司和员工三方之间有明确的协议或约定，以避免潜在的劳动纠纷。
如果子公司不是独立法人：
- 如果子公司并非独立法人，而是母公司的分支机构或办事处，那么它可能不具备独立签订劳动合同和支付工资的能力。在这种情况下，员工通常与母公司签订劳动合同，工资也由母公司支付。即使工资通过子公司账户流转，也不改变员工与母公司之间的劳动关系。
三、可能改变劳动关系的情形
虽然子公司管理发工资通常不会改变劳动关系，但在某些特定情况下，劳动关系可能会发生变化。例如：
- 劳动合同变更：如果母公司与员工协商一致，变更劳动合同中的用人单位主体，将劳动关系从母公司转移至子公司，并重新签订劳动合同，那么劳动关系就会发生改变。
- 公司重组或并购：在公司重组或并购过程中，如果员工的劳动合同被转让给新的用人单位（如子公司），且员工同意继续履行劳动合同，那么劳动关系也会相应转移。
四、法律建议
- 明确劳动合同主体：无论是母公司还是子公司，在招聘员工时，都应明确劳动合同的主体，避免产生混淆和纠纷。
- 完善内部管理制度：对于派驻到子公司的员工，母公司应建立完善的内部管理制度，明确员工的劳动关系归属、工资支付方式等关键事项，并确保员工知晓并同意这些安排。
- 及时咨询专业律师：如果公司在劳动关系管理方面存在疑问或困惑，建议及时咨询专业律师，以确保公司的用工行为符合法律法规的要求，避免潜在的法律风险。
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