结论：因第三方造成的工伤停工期工资，原则上由工伤保险基金支付停工留薪期工资，同时受伤职工有权向第三方主张侵权赔偿责任（包括误工费等）。两者并行不悖，但需避免重复获利。以下是具体分析：

一、法律关系与赔偿主体

1. 工伤保险赔偿
   根据《社会保险法》第四十二条及《工伤保险条例》第三十三条，职工因第三方原因导致工伤的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。若单位未缴纳工伤保险，则由单位承担全部赔偿责任。
   示例：员工因交通事故受伤，停工3个月，单位需按其受伤前12个月平均工资支付3个月工资。

2. 第三方侵权赔偿
   根据《民法典》第一千一百七十九条，第三方需赔偿因侵权行为导致的损失，包括误工费（即因误工减少的收入）。若第三方已支付误工费，工伤保险基金不再重复支付停工留薪期工资中对应部分；若第三方未赔偿或赔偿不足，工伤保险基金可先行支付并追偿。

二、赔偿项目与避免重复获利

1. 工伤保险覆盖项目

   • 停工留薪期工资（原工资福利）
     
   • 医疗费用、康复费用
     
   • 伤残津贴、一次性伤残补助金等
     

2. 第三方侵权覆盖项目

   • 医疗费、护理费、交通费
     
   • 误工费（与停工留薪期工资可能重叠）
     
   • 残疾赔偿金、精神损害抚慰金
     

3. 重复项目处理
   若第三方已赔偿误工费，工伤保险基金不再支付停工留薪期工资中对应部分；若第三方未赔偿，职工可同时主张工伤保险待遇和第三方侵权赔偿，但需以实际损失为限，不得重复获利。

三、赔偿顺序与操作建议

1. 优先向第三方索赔
   职工应首先通过协商、调解或诉讼要求第三方赔偿医疗费、误工费等损失。若第三方拒绝赔偿或无力赔偿，再申请工伤保险待遇。

2. 工伤保险基金的追偿权
   若工伤保险基金先行支付了停工留薪期工资或医疗费，有权向第三方追偿。职工需配合提供第三方过错证据（如交通事故责任认定书）。

3. 用人单位的责任

   • 若单位未缴纳工伤保险，需承担全部工伤保险待遇支付责任。
     
   • 若单位已缴纳工伤保险，则仅需配合职工申请工伤认定和待遇支付，无需额外赔偿停工期工资（除非第三方赔偿不足且单位自愿补足）。

四、实务操作步骤

1. 及时申请工伤认定
   职工或近亲属需在事故发生后1年内向社保部门申请工伤认定，并提供事故证据（如监控录像、证人证言）、医疗诊断证明等。

2. 进行劳动能力鉴定
   伤情稳定后，向市级劳动能力鉴定委员会申请鉴定，确定伤残等级，作为后续赔偿依据。

3. 同步主张双重赔偿

   • 向社保部门申请工伤保险待遇（含停工留薪期工资）。
     
   • 向法院起诉第三方要求侵权赔偿（含误工费、残疾赔偿金等）。
     注意：需在诉讼中明确主张“避免重复获利”，并提交工伤保险支付记录作为证据。

五、风险提示

• 证据保留：务必保存医疗记录、工资条、第三方过错证据（如交警认定书）等，以支持赔偿主张。
  
• 时效限制：工伤认定申请需在1年内提出，侵权诉讼时效为3年，逾期可能丧失权利。
  
• 单位配合：若单位拒绝协助申请工伤认定，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

总结：因第三方造成的工伤停工期工资，职工可同时主张工伤保险待遇和第三方侵权赔偿，但需避免重复获利。建议优先向第三方索赔，不足部分再通过工伤保险补足。如有复杂情况（如单位未参保、第三方拒赔），可直接向我咨询具体方案。