针对您提出的“国企迟到一次扣500元是否合法”的问题，这需要从多个角度来详细分析。

首先，我们要明确的是，用人单位（包括国企）确实有权根据自身的经营需要制定规章制度来保障单位经营的有序进行，这包括对员工迟到等行为的扣款规定。但是，这种扣款规定必须合法、合理，并且不能违反国家的相关法律法规。

从合法性的角度来看，根据《中华人民共和国劳动法》的相关规定，用人单位在制定规章制度时，应当通过民主程序，并且不违反国家法律、行政法规及规章规定。同时，这些规章制度还需要向劳动者进行公示，确保劳动者知晓并同意。如果国企的迟到扣款规定符合这些条件，那么它在程序上是合法的。

然而，合法性并不等同于合理性。在合理性方面，我们需要考虑扣款金额是否与员工缺勤的时间、造成的损失等相匹配。如果国企规定迟到一次就扣500元，这个金额是否过高，是否超出了员工缺勤时间所应承担的合理损失范围，这是需要仔细评估的。特别是当这个扣款金额远超过员工缺勤时间的工资时，企业可能构成未足额支付劳动报酬的违法行为，因为这相当于对员工进行了不合理的罚款。

另外，我们还需要注意到，全勤奖和迟到扣款是两个不同的概念。全勤奖是用人单位为鼓励员工按时上下班而设置的一项奖惩制度，它属于工资总额中的奖金范畴。如果全勤奖是工资的一部分，那么因为迟到就扣除全部全勤奖，且这部分金额远超过员工缺勤时间的工资，这也是不合法的。

在实际操作中，如果国企的迟到扣款规定存在不合理之处，或者扣款金额过高，员工有权向劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁等途径来维护自己的合法权益。

综上所述，国企迟到一次扣500元是否合法，需要看其规章制度是否合法制定并公示，以及扣款金额是否合理。如果规章制度合法且扣款金额合理，那么这种做法是合法的；但如果规章制度存在瑕疵或者扣款金额过高，那么这种做法就可能存在问题。因此，建议您先仔细查阅国企的规章制度，了解迟到扣款的具体规定和金额，如果认为不合理，可以向相关部门进行咨询或投诉。