迟到一次扣五十元是否合法，主要取决于用人单位是否有明确且合法的规章制度作为依据，以及扣款金额是否合理且符合法律法规的限制。以下是对此问题的详细分析：
合法的情形
规章制度明确且合法：
- 用人单位已依法制定规章制度，并明确规定迟到扣除工资的标准（如迟到一次扣50元）。
- 规章制度的制定经过了民主程序，如职工代表大会讨论通过，并已向全体员工公开公示。
- 扣款行为符合规章制度的规定，且每月所扣除的金额不得超过劳动者当月工资的20%，扣除后的剩余工资部分也不得低于当地月最低工资标准。
扣款金额合理：
- 扣款金额与劳动者迟到行为对工作造成的影响相适应，不显得过高或过低。
不合法的情形
无规章制度依据：
- 用人单位没有制定相关规章制度，或规章制度中没有明确规定迟到扣款的标准，则扣款行为可能不合法。
规章制度制定程序不合法：
- 如果规章制度的制定未经过民主程序，或未向全体员工公开公示，那么该规章制度可能无效，基于此的扣款行为也就不合法。
扣款金额不合理：
- 如果扣款金额超过了劳动者当月工资的20%，或扣除后的剩余工资低于当地月最低工资标准，那么扣款行为不合法。
其他不合理情况：
- 即使有用人单位合法的规章制度规定迟到扣工资，但如果扣款金额明显与劳动者迟到行为对工作造成的影响不成比例，也可能被视为不合理而不合法。
法律依据
- 《中华人民共和国劳动法》第四十三条规定，用人单位不得克扣劳动者的工资，但合理的罚款因劳动者违规行为导致的不在此限制之内。
- 《工资支付暂行规定》第十六条进一步明确了因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失时，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，并从工资中扣除，但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。
实践建议
- 对于用人单位而言，应确保规章制度的合法性、合理性和透明性，避免随意扣款引发劳动争议。
- 对于劳动者而言，在面临不合理扣款时，应与用人单位协商解决；协商不成时，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁以维护自身权益。
综上所述，迟到一次扣五十元是否合法，需要综合考虑多个因素。如果你在这方面遇到了问题，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况给出更详细的法律建议。