结论前置：员工看手机超过5分钟被扣钱是否合法，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
公司规章制度的角度：
- 合法情形：如果公司有明确的规章制度，规定员工在工作时间内不得长时间看手机，且该制度已经过民主程序制定（如职工代表大会或全体职工讨论通过），并向员工进行了公示或告知，那么员工违反此规定，公司依据制度进行扣款，在合理范围内是合法的。这里的“合理范围”通常指的是扣款金额不得超过员工当月工资的20%，且扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。
- 不合法情形：若公司没有相关规章制度，或者规章制度未经民主程序制定，未向员工公示或告知，那么公司以此为由扣款则缺乏法律依据，属于违法行为。
劳动合同约定的角度：
- 合法情形：如果劳动合同中明确约定了员工在工作时间内不得长时间看手机，且违反此约定公司有权进行扣款，那么这种约定在双方自愿、平等的基础上是有效的，公司可以依据合同进行扣款。
- 不合法情形：若劳动合同中没有此类约定，或者约定不明确，公司则不能仅凭此理由进行扣款。
扣款合理性的角度：
- 即使公司有规章制度或劳动合同中有相关约定，扣款也必须合理。如果扣款金额过高，或者扣款行为过于频繁，可能被视为对员工权益的侵害，此时员工有权向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
法律建议：
- 对于员工而言，如果认为公司的扣款行为不合法，可以先与公司进行沟通协商，要求公司说明扣款的依据和合理性。如果协商无果，可以向当地的劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。
- 对于公司而言，在制定规章制度或劳动合同条款时，应确保内容合法、合理，并经过民主程序制定，向员工进行公示或告知。同时，在执行扣款等处罚措施时，也应确保扣款金额和方式的合理性，避免引发劳动纠纷。
可能的法律后果：
- 如果公司的扣款行为被认定为违法，可能需要向员工支付被扣的工资，并可能面临劳动监察部门的处罚。
- 如果员工因公司的违法扣款行为而提起劳动仲裁或诉讼，公司还可能需要承担额外的法律费用和赔偿责任。
总之，员工看手机超过5分钟被扣钱是否合法，需根据公司的规章制度、劳动合同约定以及扣款的合理性来综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。