结论：市场监督管理局立案后，商标权利人和侵权人和解了，市场监督管理局仍可能根据具体情况对侵权人进行处罚，但一般不会对商标权利人进行处罚。
分析说明：
市场监督管理局的处罚权：
- 市场监督管理局作为行政机关，在商标侵权案件中具有独立的行政处罚权。其立案调查的目的是为了维护市场秩序，保护消费者和商标权利人的合法权益。
- 即便商标权利人和侵权人之间达成了和解，这并不影响市场监督管理局根据调查结果对侵权人进行行政处罚的权力。和解是民事行为，而行政处罚是行政行为，两者性质不同，互不干扰。
和解对处罚的影响：
- 和解可能表明商标权利人不再追求民事赔偿或要求侵权人承担其他民事责任，但这并不意味着侵权人的违法行为得到了行政上的豁免。
- 市场监督管理局在决定是否处罚时，会综合考虑侵权行为的性质、情节、后果以及和解的情况等因素。如果侵权行为严重，即便双方和解，市场监督管理局仍可能对侵权人进行处罚。
对商标权利人的处罚：
- 在商标侵权案件中，商标权利人通常是受害者，其合法权益受到了侵害。因此，市场监督管理局一般不会对商标权利人进行处罚。
- 除非商标权利人本身存在违法行为，如恶意投诉、虚假陈述等，否则市场监督管理局不会因其与侵权人的和解而对其实施处罚。
特殊场景：
- 如果和解协议中包含了侵权人承诺接受市场监督管理局的行政处罚等条款，那么市场监督管理局在处罚时可能会考虑这些因素，但并不会因此改变其处罚的法律依据和原则。
后续行动建议：
- 对于商标权利人而言，即便与侵权人达成了和解，也应关注市场监督管理局的处罚决定，确保自己的合法权益得到充分保护。
- 对于侵权人而言，和解并不意味着可以逃避行政处罚。应积极配合市场监督管理局的调查工作，如实陈述事实，争取从轻或减轻处罚。
法律依据：
- 《中华人民共和国商标法》第六十条规定，有本法第五十七条所列侵犯注册商标专用权行为之一，引起纠纷的，由当事人协商解决；不愿协商或者协商不成的，商标注册人或者利害关系人可以向人民法院起诉，也可以请求工商行政管理部门处理。工商行政管理部门处理时，认定侵权行为成立的，责令立即停止侵权行为，没收、销毁侵权商品和主要用于制造侵权商品、伪造注册商标标识的工具，违法经营额五万元以上的，可以处违法经营额五倍以下的罚款，没有违法经营额或者违法经营额不足五万元的，可以处二十五万元以下的罚款。对五年内实施两次以上商标侵权行为或者有其他严重情节的，应当从重处罚。销售不知道是侵犯注册商标专用权的商品，能证明该商品是自己合法取得并说明提供者的，由工商行政管理部门责令停止销售。
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