若营业执照与店名不一致，在申请劳动仲裁时，关键在于证明实际用工主体与营业执照登记主体的一致性或关联性，可通过收集相关证据来明确劳动关系中的实际用人单位，以此保障仲裁申请的受理与推进。具体分析如下：

1. 明确劳动关系中的实际用人单位
   根据《劳动争议调解仲裁法》及相关规定，劳动仲裁的被申请人应为与劳动者建立劳动关系的用人单位。若店名与营业执照登记名称不一致，需通过证据证明实际用工主体。例如：

   • 劳动合同：若合同中明确约定用人单位名称（与营业执照一致），即使店名不同，仍以合同主体为准；
     
   • 工资支付记录：如银行流水、转账记录显示付款方为营业执照登记主体或其关联方；
     
   • 工作证、考勤记录：若证件或记录中载明用人单位名称与营业执照一致；
     
   • 其他证据：如社保缴纳记录、税务登记信息、公章使用记录等，均可辅助证明实际用工关系。

2. 若店名为分支机构或个体工商户字号

   • 若店名为营业执照登记主体的分支机构（如分公司），需确认分支机构是否具备独立用工主体资格。根据《公司法》，分公司不具有法人资格，其民事责任由总公司承担，此时应以总公司为被申请人；
     
   • 若店名为个体工商户的字号（如“XX店”），营业执照登记主体为个人经营者，则应以个体工商户经营者为被申请人，并注明其身份证号及经营地址。

3. 证据不足时的处理方式
   若劳动者无法直接证明实际用工主体，可尝试以下途径：

   • 向市场监管部门查询：申请调取用人单位的工商内档，确认其实际经营名称、地址及关联企业信息；
     
   • 申请仲裁委调查取证：根据《劳动争议调解仲裁法》第六条，当事人因客观原因不能自行收集的证据，仲裁委员会可依职权调查；
     
   • 以营业执照登记主体为被申请人：若店名与营业执照无直接关联，但劳动者能证明实际受该主体管理（如工作安排、工资发放均由其控制），可主张其承担用工责任。

4. 仲裁申请书的填写建议
   在仲裁申请书中，应明确以下内容：

   • 被申请人信息：填写营业执照登记的全称、统一社会信用代码、法定代表人或经营者姓名及联系方式；
     
   • 事实与理由：详细说明店名与营业执照不一致的情况，并附证据证明实际用工关系；
     
   • 请求事项：根据劳动关系主体，明确要求支付工资、经济补偿等具体诉求。

提示：若用人单位故意通过店名与营业执照不一致规避责任，劳动者可同时向劳动监察部门投诉，要求查处其违法行为，并保留相关证据以支持仲裁申请。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。