当公司名称与营业执照上的名称不一致时，你仍然可以进行劳动仲裁，但需要注意一些关键步骤和细节，以确保仲裁的顺利进行。以下是从不同角度为你详细分析的情况和建议：

一、确认实际用人单位

1. 核实信息：首先，你需要确认与你实际建立劳动关系的用人单位是哪一个。这通常可以通过劳动合同、工资发放记录、工作证、考勤记录等证据来证明。即使公司名称与营业执照上的名称不一致，这些证据也能帮助你识别实际的用人单位。
2. 关注主体资格：在仲裁时，你需要确保将具有主体资格的用人单位列为被申请人。如果营业执照上的名称与实际用人单位名称不一致，但两者存在关联关系（如分公司与总公司），你可能需要将两者都列为被申请人，或者根据具体情况选择正确的被申请人。

二、准备仲裁材料

1. 仲裁申请书：在撰写仲裁申请书时，你需要明确写明申请人的信息、被申请人的信息（包括名称、地址、法定代表人等）、仲裁请求、事实和理由等。如果公司名称与营业执照不一致，你需要在申请书中准确描述这一情况，并附上相关证据。
2. 证据材料：除了仲裁申请书外，你还需要准备一系列证据材料来支持你的仲裁请求。这些证据材料可能包括劳动合同、工资单、工作证、考勤记录、同事证言等。确保这些证据能够证明你与用人单位之间存在劳动关系，以及用人单位存在违法行为（如未支付工资、未缴纳社保等）。

三、选择正确的仲裁机构

1. 确定管辖范围：劳动争议由劳动合同履行地或者用人单位所在地的劳动争议仲裁委员会管辖。你需要根据实际情况选择正确的仲裁机构进行申请。
2. 了解仲裁流程：在申请仲裁前，你可以先了解当地的仲裁流程和要求，以便更好地准备仲裁材料和应对仲裁过程。

四、可能遇到的法律后果及建议

1. 仲裁结果的不确定性：由于公司名称与营业执照不一致可能增加案件的复杂性，仲裁结果可能存在一定的不确定性。因此，在申请仲裁前，你需要充分评估案件的风险和可能的结果。
2. 寻求法律援助：如果你对仲裁过程或法律条款不熟悉，建议寻求专业的法律援助或咨询。我可以为你提供专业的法律意见和帮助，确保你的权益得到充分保障。
3. 保持沟通：在仲裁过程中，与仲裁机构和用人单位保持沟通是非常重要的。这有助于你及时了解案件进展情况，并根据需要调整仲裁策略。

总结来说，虽然公司名称与营业执照不一致可能给劳动仲裁带来一定的挑战，但只要你能够准确识别实际用人单位、准备充分的仲裁材料、选择正确的仲裁机构，并寻求专业的法律援助，你仍然可以有效地维护自己的合法权益。如果你有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。