针对您提出的“签劳动合同和发薪水交社保是A公司，但实际为B公司工作，应该如何仲裁”的问题，这确实是一个涉及复杂劳动关系的情形。以下是我为您提供的详细解答：
一、能否仲裁B公司的核心判断
在决定是否将B公司作为仲裁对象时，关键在于判断B公司在您与A公司的劳动关系中扮演了何种角色，以及是否承担了用人单位的相应责任。这通常取决于B公司是否对您的劳动进行了实质性的管理，如工作安排、监督、考勤等，并决定了您的薪酬待遇。
二、可以仲裁B公司的具体情形
构成双重劳动关系或实际用人单位：
- 如果您在为A公司提供劳动的同时，也为B公司提供了实质性的劳动，且B公司对您的劳动进行了管理，并决定了您的薪酬，那么可能构成双重劳动关系，或者B公司被视为实际用人单位。在此情形下，您有权就劳动争议仲裁B公司。
B公司承担用人单位责任：
- 即使您与A公司签订了劳动合同，但如果B公司在实际工作中承担了用人单位的主要职责，如日常管理、工作安排、薪酬支付等，并且这种安排得到了您的同意，那么B公司在某种程度上就承担了用人单位的相应责任。因此，您有权将B公司作为仲裁对象。
连带责任情况：
- 如果A公司与B公司之间存在违法转包、分包等行为，导致您的权益受损，根据相关法律法规，B公司可能需要与A公司承担连带赔偿责任。在这种情况下，您可以将B公司列为共同被申请人进行仲裁。
劳务派遣或借用员工：
- 如果您是通过劳务派遣或借用员工的用工方式，与A公司签订劳动合同，但实际用工单位是B公司，且B公司负责支付工资和缴纳社保，那么B公司实际上履行了用人单位的职责。在发生劳动争议时，您可以将B公司作为仲裁对象或共同被申请人。
三、一般不能仲裁B公司的情形
- 如果您仅与A公司存在劳动关系，而B公司只是受A公司委托代发工资、代缴社保，并未对您的劳动进行实际的劳动管理，也未与您建立劳动关系的合意，那么您通常不能就劳动争议仲裁B公司。这种情况下，B公司只是履行委托事项，不承担用人单位的责任。
四、实际操作建议
查看劳动合同条款：
- 仔细审查与A公司签订的劳动合同，关注其中关于工资支付、社保缴纳以及实际工作安排的明确条款。这些条款对于判断劳动关系及确定责任主体至关重要。
收集证据：
- 为了支持自己的主张，您应收集相关证据，如工作证、考勤记录、工资发放记录、工作安排邮件等。这些证据有助于证明B公司在劳动关系中的实际角色和行为。
咨询专业意见：
- 在处理复杂的劳动关系时，建议您咨询当地的劳动监察部门或专业律师。他们可以根据您的具体情况，提供更准确的法律判断和建议，帮助您维护自己的合法权益。
综上所述，能否仲裁B公司取决于多种因素，包括B公司在劳动关系中的实际角色和行为、劳动合同的具体条款以及相关法律法规的规定。在面临此类问题时，请务必仔细分析自己的具体情况，并寻求专业法律帮助以维护自己的合法权益。