在处理您提出的“交社保在A公司，是否可以申请B公司劳动仲裁”这一问题时，我们需要细致分析多种因素来确定答案。
首先，要明确的是，能否将B公司作为劳动仲裁的对象，主要取决于B公司在您劳动关系中的实际角色和行为，以及您与A公司签订的劳动合同的具体条款。
可以仲裁B公司的情形：
构成双重劳动关系或实际用人单位：如果您在为A公司提供劳动的同时，也为B公司提供了劳动，并且B公司对您的劳动进行了实质性的管理（比如安排工作、监督工作进度、进行考勤等），同时决定了您的薪酬待遇，那么可能构成双重劳动关系，或者B公司被视为实际用人单位。在这种情况下，您有权就劳动争议仲裁B公司。
B公司承担用人单位责任：即使您的劳动合同是与A公司签订的，但如果B公司在实际工作中承担了用人单位的主要职责（如日常管理、工作安排、薪酬支付等），并且这种安排得到了您的同意，那么B公司在某种程度上就承担了用人单位的相应责任。因此，您也有权将B公司作为仲裁对象。
连带责任情况：如果A公司与B公司之间存在违法转包、分包等行为，导致您的权益受损，根据相关法律法规，B公司可能需要与A公司承担连带赔偿责任。在这种情况下，您可以将B公司列为共同被申请人进行仲裁。
劳务派遣或借用员工：在劳务派遣或借用员工的用工方式中，虽然您与派遣单位（A公司）签订劳动合同，但实际用工单位（B公司）负责支付工资和缴纳社保。如果B公司实际上履行了用人单位的职责，您在发生劳动争议时同样可以将B公司作为仲裁对象或共同被申请人。
一般不能仲裁B公司的情形：
如果您的劳动关系仅与A公司存在，而B公司只是受A公司委托代发工资、代缴社保，并未对您的劳动进行实际的劳动管理，也未与您建立劳动关系的合意，那么您通常不能就劳动争议仲裁B公司。因为这种情况下，B公司只是履行委托事项，不承担用人单位的责任。
实际操作建议：
查看劳动合同条款：仔细审查您与A公司签订的劳动合同，特别是关于工资支付、社保缴纳以及实际工作安排的条款。这些条款对于判断劳动关系及确定责任主体至关重要。
收集证据：为了支持自己的主张，您应收集相关证据，如工作证、考勤记录、工资发放记录、工作安排邮件等。这些证据有助于证明B公司在您劳动关系中的实际角色和行为。
咨询专业意见：在处理复杂的劳动关系时，建议您咨询当地的劳动监察部门或专业律师。他们可以根据您的具体情况，提供更准确的法律判断和建议，帮助您维护自己的合法权益。
综上所述，能否仲裁B公司取决于多种因素。在面临此类问题时，请务必仔细分析自己的具体情况，并寻求专业法律帮助以做出明智的决策。