公司搬迁到另外一个城市但社保仍在本市交，这种情况一般可以申请劳动仲裁。不过，具体能否申请以及申请的结果，还需要根据以下几个方面来详细分析：

1. 劳动合同约定：首先要查看你的劳动合同中是否有关于工作地点和社保缴纳的明确约定。如果合同中明确规定了工作地点，且公司搬迁超出了合同约定的范围，同时社保缴纳又未做相应调整，那么这很可能构成了公司违约，你可以据此申请劳动仲裁。

2. 实际工作地点与社保缴纳地不一致的影响：公司搬迁到另一个城市，而社保仍在本市交，这种实际工作地点与社保缴纳地不一致的情况，可能会对你的社保权益造成影响，比如医疗保险的报销、养老保险的领取等。如果这种不一致导致了你的权益受损，你也可以申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

3. 劳动仲裁的受理范围：劳动仲裁主要受理因履行劳动合同发生的争议，包括但不限于劳动报酬、工作时间、休息休假、社会保险等方面。公司搬迁导致的社保缴纳问题，如果属于劳动合同履行过程中的争议，且符合劳动仲裁的受理范围，那么你就可以申请劳动仲裁。

4. 申请劳动仲裁前的准备：在决定申请劳动仲裁前，建议你先与公司进行沟通协商，尝试通过和解的方式解决问题。如果协商无果，你可以准备好相关证据材料，如劳动合同、社保缴纳记录、搬迁通知等，向当地的劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请。

综上所述，公司搬迁到另外一个城市但社保仍在本市交的情况，一般是可以申请劳动仲裁的。但具体能否申请以及申请的结果如何，还需要根据你的劳动合同约定、实际工作地点与社保缴纳地不一致的影响、劳动仲裁的受理范围以及你自身的准备情况来综合考虑。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。