针对“员工拿走劳动合同不承认签署”这一问题，我的结论是：企业可以通过多种途径来证明劳动合同的存在及员工的签署情况，以维护自身合法权益。以下是从不同角度的详细分析：

1. 劳动合同的证明责任：

   • 在劳动争议中，劳动合同是证明劳动关系存在及双方权利义务的重要依据。若员工拿走劳动合同并否认签署，企业需承担证明劳动合同存在及员工已签署的举证责任。

2. 证明劳动合同存在及签署情况的途径：

   • 其他副本或复印件：企业应保留劳动合同的副本或复印件，这些文件可以作为证明劳动合同存在及员工签署情况的直接证据。
   • 员工入职手续：员工入职时填写的入职表、登记表等文件，若其中包含员工确认已阅读并签署劳动合同的声明，也可作为辅助证据。
   • 工资发放记录：企业可以通过提供工资发放记录，证明与员工之间存在劳动关系，并间接证明劳动合同的存在。因为工资发放通常是基于劳动合同的约定进行的。
   • 同事证言：其他员工的证言，特别是那些见证员工签署劳动合同或了解相关情况的员工，他们的证言可以作为间接证据。
   • 电子证据：如果劳动合同是通过电子方式签署的，企业应保留相关的电子证据，如电子邮件、短信通知、电子签名记录等。这些电子证据在符合法律规定的情况下，具有与纸质证据同等的法律效力。
   • 申请司法鉴定：在必要时，企业可以向法院申请对劳动合同上的签名进行司法鉴定，以确认签名的真实性。

3. 法律建议：

   • 完善劳动合同管理：企业应建立完善的劳动合同管理制度，确保劳动合同的签署、保管、归档等环节都有明确的流程和责任人。同时，应保留劳动合同的副本或复印件，以备不时之需。
   • 加强员工入职教育：在员工入职时，企业应明确告知员工劳动合同的重要性及签署流程，确保员工了解并同意签署劳动合同。
   • 及时采取法律措施：若员工否认签署劳动合同并引发劳动争议，企业应及时收集相关证据，并咨询专业律师，以便在争议中维护自身合法权益。

4. 可能的法律后果：

   • 若企业无法证明劳动合同的存在及员工的签署情况，可能面临支付双倍工资、承担违法解除劳动合同的赔偿责任等法律风险。因为根据《劳动合同法》的相关规定，用人单位未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。同时，若因未签订劳动合同而导致违法解除劳动合同的，用人单位还需承担相应的赔偿责任。

综上所述，企业应通过多种途径来证明劳动合同的存在及员工的签署情况，以维护自身合法权益。若遇到相关问题，可直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供进一步的法律建议。