陪产假包含周末时，综合工时的计算方式需结合具体法律法规及单位规章制度综合判断，但核心原则是：陪产假天数按自然日计算，包含周末；综合工时制下，陪产假期间不涉及工时抵扣或加班费计算问题。以下是具体分析：

一、陪产假天数是否包含周末？

1. 按自然日计算
   根据《人口与计划生育条例》及各地实施细则，陪产假通常以“天”为单位，且明确包含周末和法定节假日。例如：

   • 《北京市人口与计划生育条例》规定，男方享受15天陪产假，含周末；
     
   • 《上海市人口与计划生育条例》规定，男方享受10天陪产假，同样包含周末。
     结论：陪产假天数按自然日连续计算，周末属于假期范围，无需额外扣除。

2. 单位规章制度不得缩减假期
   若单位规章制度中规定“陪产假不包含周末”或“周末需补班”，该条款因违反法律强制性规定而无效。员工有权拒绝单位的不合理要求，并可向劳动监察部门投诉。

二、综合工时制下，陪产假如何计算工时？

1. 综合工时制的核心特点
   综合工时制以周、月、季、年为周期综合计算工作时间，平均日/周工作时间不超过法定标准（如每日8小时、每周40小时）。其核心是“工时总量控制”，而非“每日固定工时”。

2. 陪产假期间不涉及工时抵扣

   • 陪产假属于法定带薪休假，员工在假期内无需提供劳动，单位不得要求员工用后续工作时间抵扣假期；
     
   • 综合工时制下，员工在周期内总工时未超标的，陪产假期间不产生加班费；若总工时已超标，陪产假期间也不视为加班（因假期本身不计算工时）。
     举例：某员工实行以月为周期的综合工时制，月标准工时160小时。若该员工当月休10天陪产假（含周末），实际出勤15天（120小时），总工时未超标，无需支付加班费；若该员工当月出勤20天（160小时）后休陪产假，总工时仍为160小时，同样无需支付加班费。

3. 单位不得因陪产假调整周期工时
   单位不得以“员工休陪产假导致周期内工时不足”为由，要求员工在后续周期内补足工时或扣减工资。此行为违反《劳动法》关于“工资分配应当遵循按劳分配原则”的规定。

三、实务建议

1. 员工注意事项

   • 提前了解当地陪产假具体天数及是否包含周末（可通过当地人社局官网查询）；
     
   • 保留休假申请记录、单位批准文件等证据，避免纠纷；
     
   • 若单位拒绝批假或扣减工资，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

2. 单位合规建议

   • 在规章制度中明确陪产假天数及计算方式（需符合地方性法规）；
     
   • 不得将陪产假与工时抵扣、加班费计算挂钩；
     
   • 规范休假审批流程，避免因程序瑕疵引发纠纷。

总结：陪产假按自然日计算，包含周末；综合工时制下，陪产假期间不涉及工时抵扣或加班费问题。若您遇到单位违规操作，可直接向我咨询具体维权方案。