针对您提出的“入职第一个月被扣了两个月五险是否合法”的问题，这需要根据具体情况来详细分析。
首先，从一般原则来看：
根据《中华人民共和国社会保险法》及相关规定，用人单位应在员工入职当月为其办理社会保险登记，并按时足额缴纳当月的社会保险费用。因此，在大多数情况下，入职首月即扣除2个月社保费用的做法是不合法的。
接下来，我们分析可能存在的特殊情况：
社保缴纳规则与工资发放时间差异：
- 如果员工入职时间接近月底，而单位社保缴费申报周期已截止，那么可能会出现次月一并缴纳并扣除两个月社保费的情况。但这必须符合当地社保部门的规定，并且用人单位需要向员工清晰解释原因。
- 工资发放周期与社保缴纳时间不一致也可能导致类似情况。例如，公司本月发放上月工资，而新员工上月入职，则本月发工资时可能扣除上月及本月社保。但这并非普遍适用的合法理由，仍需谨慎判断。
公积金开户及补缴情况：
- 公积金的开户和缴纳流程与社保类似。如果员工入职时公积金账户开设不及时或错过公积金汇缴时间，也可能导致补缴情况的发生，从而出现首月工资扣除两个月公积金费用的情况。
企业操作失误或特殊规定：
- 企业财务人员或人事专员可能因疏忽或业务不熟练导致社保费用计算错误，误将两个月的费用一并扣除。
- 有些公司可能规定员工入职后第一个月需自行承担五险一金费用，或存在其他特殊规定。但这类规定必须在劳动合同中明确约定，并且不得违反法律法规的强制性规定。
针对您的情况，我给出以下建议：
及时沟通：
- 您应与用人单位的人力资源部门或财务部门进行沟通，了解扣除2个月社保费用的具体原因，并要求提供合理的解释和政策依据。
核实情况：
- 您可以核实公司的工资发放周期、社保缴纳时间、公积金开户及补缴情况等，以判断是否存在特殊情况导致扣除两个月社保费用。
维护权益：
- 如果用人单位无法给出合理解释或确实存在违规行为，您有权向当地的劳动监察部门或社保部门进行投诉举报，要求用人单位纠正错误，补缴社保或退还多扣的社保费用。
- 在投诉或申请劳动仲裁时，您应准备好相关证据，如工资条、社保缴费记录、劳动合同等，以证明自己的权益受到了侵害。
总结：
入职第一个月被扣了两个月五险，在大多数情况下是不合法的。但也可能存在特殊情况导致这一现象的发生。因此，您应及时与用人单位沟通并核实原因，依法维护自身权益。同时，也建议用人单位加强内部管理，确保社保缴纳的合规性，避免因操作失误或管理不善而导致员工的权益受损。