针对您提出的“公司第一个月扣两个月社保是否合法”的问题，以下是我的详细解答：
结论前置：在大多数情况下，公司第一个月扣除两个月社保费用是不合法的。根据《中华人民共和国社会保险法》及相关规定，用人单位应在员工入职当月为其缴纳社保，且通常只能扣除当月的社保费用。
一、合法性分析
一般原则：
- 社保是按月进行申报和缴纳的，与员工当月的工资收入和工作情况相对应。因此，公司第一个月扣除两个月社保费用，通常不符合常规的社保缴纳逻辑。
法律依据：
- 《中华人民共和国社会保险法》明确规定，员工和用人单位都有义务按时足额缴纳社会保险费。入职当月工资中只能扣除当月的社保费用，不能扣除两个月的费用。用人单位若一次扣取劳动者两个月的社保个人部分，通常属于违规操作。
二、可能的原因及核实
尽管一般情况下公司第一个月扣两个月社保是不合法的，但也存在一些特殊情况或误解可能导致这一现象。您可以与公司沟通核实以下原因：
补扣前期应缴费未缴的情况：
- 确认公司是否在您入职前存在未按时缴纳社保的情况，导致需要后续补扣。
新员工参保或社保建账规则：
- 新员工当月参保可能会在次月产生当月和次月两个月的费用，因为新员工的参保信息在社保系统中需要次月才能完全建立。但这种情况应提前向您说明。
公司操作习惯或失误：
- 了解公司是否存在一次性扣除两个月社保费用的操作习惯，或者是否存在操作失误导致多扣。
工资发放周期影响：
- 如果公司发工资日期是本月发上月工资，且您是上月入职，则本月扣费可能需要扣缴上月和本月的社保。但这种情况也应提前与您沟通并明确说明。
三、应对建议
与公司沟通：
- 首先，建议您与公司的人力资源部门或财务部门进行沟通，了解扣除两个月社保费用的具体原因，并要求提供合理的解释和政策依据。
要求纠正错误：
- 如果公司无法给出合理解释或确实存在违规行为，您有权要求公司纠正错误，调整社保扣除金额，并确保后续按法规缴纳。
维护权益：
- 若与公司沟通无果，您可以向当地的劳动监察部门或社保部门进行投诉举报，要求公司纠正错误，补缴社保或退还多扣的社保费用。在投诉时，请准备好相关证据，如工资条、社保缴费记录、劳动合同等。
预防措施：
- 为避免类似情况再次发生，建议您在入职前详细了解公司的社保缴纳政策，包括缴纳时间、基数、比例等，并在劳动合同中明确约定。同时，持续关注个人社保账户的缴费情况，确保公司按规定缴纳。
综上所述，公司第一个月扣除两个月社保费用在大多数情况下是不合法的。您应与公司沟通核实原因，并采取相应措施维护自己的合法权益。