农村门市房没有房产证，买卖签订的协议在特定条件下具有法律效力，但存在较大法律风险。以下从不同角度为你详细分析：

协议可能具有法律效力的情形

1. 协议内容合法且双方真实意思表示
   • 如果买卖双方签订的协议内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，并且是双方基于真实意愿达成的，那么这份协议在双方之间是具有法律约束力的。例如，协议中明确约定了房屋的基本情况（如位置、面积等）、买卖价格、付款方式、交付时间以及违约责任等重要条款，双方都清楚并认可这些内容，那么从合同法的角度来看，这份协议是有效的。
   • 举例来说，甲乙双方就农村的一处门市房达成买卖意向，虽然该房屋没有房产证，但双方在协议中详细约定了房屋的相关信息，甲愿意以一定价格出售给乙，乙也同意购买，并且双方都在协议上签字确认，这种情况下协议是有效的。
2. 房屋产权清晰无争议
   • 即使房屋没有房产证，但如果能够证明房屋的产权归属清晰，不存在其他权利人的争议，那么买卖协议也可能被认定为有效。比如，该房屋是卖方通过合法途径建造或者继承、受赠等方式取得，且在当地村委会或相关部门有相关的登记记录，能够证明卖方对房屋拥有合法的处分权。
   • 假设某农村门市房是卖方自家建造，在建造时经过了村委会的批准，并且在村里的土地使用登记簿上有相应的记录，能够明确该房屋归卖方所有，此时买卖双方签订的协议就可能具有法律效力。

协议可能面临的法律风险及无效情形

1. 房屋产权存在争议
   • 如果房屋的产权存在争议，例如存在多个权利人主张权利，或者房屋是违法建筑等情况，那么买卖协议可能会被认定为无效。因为这种情况下，卖方可能并不拥有房屋的合法处分权，其签订的买卖协议无法得到法律的保护。
   • 例如，某农村门市房是卖方在未取得相关审批手续的情况下私自建造的，属于违法建筑，那么卖方与买方签订的买卖协议就可能因违反法律法规的强制性规定而被认定为无效。
2. 无法办理产权过户手续
   • 没有房产证的房屋在办理产权过户手续时会遇到很大的困难。根据相关法律规定，房屋产权的变更需要进行登记，而房产证是房屋产权的重要证明文件。如果没有房产证，就无法完成产权过户登记，买方也就无法真正取得房屋的所有权。
   • 即使买卖协议有效，但由于无法办理产权过户手续，买方的权益可能无法得到充分保障。例如，如果卖方在签订协议后又将房屋出售给第三人，并且第三人办理了产权过户手续，那么买方可能只能依据买卖协议向卖方主张违约责任，而无法取得房屋的所有权。

法律建议

1. 在签订协议前，务必核实房屋的产权情况
   • 买方可以要求卖方提供相关的证明文件，如土地使用证、建房审批手续等，以确认房屋的产权归属和合法性。同时，还可以到当地的村委会或相关部门进行查询，了解房屋是否存在产权争议或其他问题。
2. 在协议中明确约定违约责任和解决争议的方式
   • 由于没有房产证的房屋买卖存在较大的法律风险，因此在协议中明确约定违约责任和解决争议的方式非常重要。例如，可以约定如果因卖方的原因导致无法办理产权过户手续，卖方应承担的违约责任，以及双方发生争议时的解决方式（如仲裁或诉讼等）。
3. 考虑暂缓购买或寻求其他保障措施
   • 如果房屋的产权情况存在较大不确定性，或者无法办理产权过户手续的风险较大，买方可以考虑暂缓购买，等待房屋取得房产证后再进行交易。或者，可以要求卖方提供一定的担保措施，如提供抵押物或找第三方担保等，以降低自己的风险。

总之，农村门市房没有房产证买卖签订协议具有一定的复杂性，涉及到的法律问题较多。如果你有相关的法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供更详细、更专业的解答。