部门主管发函辞退员工是否违法，不能一概而论，关键在于发函的内容、程序是否符合法律规定。以下从不同角度进行分析：

一、发函内容合法性

1. 若发函内容符合法定解除条件：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条至第四十一条，用人单位解除劳动合同需有法定事由，如员工严重违反规章制度、不能胜任工作等。若部门主管发函中明确列出了符合法律规定的解除事由，并附有相关证据，且该事由确实存在，则发函辞退可能合法。
   • 举例：员工因严重失职给公司造成重大损害，部门主管发函辞退，并附有损失证明和员工失职的相关证据，此时发函辞退可能合法。

2. 若发函内容不符合法定解除条件：

   • 若部门主管发函中列出的解除事由不符合法律规定，或没有附上相关证据，或该事由并不存在，则发函辞退可能违法。
   • 举例：部门主管仅因个人喜好或无充分理由发函辞退员工，此时发函辞退违法。

二、发函程序合法性

1. 书面通知义务：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》，用人单位解除劳动合同时，必须以书面形式通知劳动者，并说明解除合同的原因、依据及生效时间。若部门主管发函符合这一要求，则程序合法。
   • 若未履行书面通知义务：即使解除事由合法，未以书面形式通知也可能构成违法解除。此时，用人单位需按经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金（工作每满一年支付两个月工资）。

2. 工会通知程序（如适用）：

   • 若用人单位建立了工会组织，且解除劳动合同符合《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条、第四十条规定，但未按照第四十三条规定事先通知工会，劳动者可以用人单位违法解除劳动合同为由请求支付赔偿金。不过，若起诉前用人单位已经补正有关程序，则可能免除赔偿责任。

三、合法辞退的正确流程

为确保辞退行为的合法性，用人单位应遵循以下流程：

1. 书面送达解除通知书：

   • 制作包含解除依据条款、事实描述、生效日期的正式文件。
   • 通过EMS邮寄（留存签收回执）或当面签收方式送达员工。

2. 办理离职交接手续：

   • 完成工作交接清单签署、归还公司财物、结算薪资等程序。
   • 出具加盖公章的离职证明。

3. 支付法定补偿金（如适用）：

   • 符合《中华人民共和国劳动合同法》第四十六条情形的，需在办结手续时一次性支付N+1经济补偿（N为工作年限）。

四、法律后果与建议

• 若部门主管发函辞退违法：员工有权通过劳动仲裁或诉讼主张违法解除的赔偿责任，包括要求用人单位支付赔偿金、补发工资或恢复劳动关系等。
• 建议：用人单位在辞退员工时，应确保解除事由合法、程序合规，并保留好相关证据。员工在收到辞退通知时，也应仔细审查通知内容，如有疑问或认为解除行为违法，可及时咨询专业律师并考虑通过法律途径维护自身权益。

有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况，给出更详细的法律建议。