如果遇到公司出具的证明中写明“个人原因”而您不认同，且公司拒绝修改的情况，您可以按照以下步骤处理：
明确争议焦点，收集证据
首先需明确您不认同“个人原因”的具体理由（例如：离职实际是公司裁员、合同未续签等）。随后收集能证明真实原因的证据，包括但不限于：
- 劳动合同、续签协议等书面文件；
- 离职前与公司沟通的录音、聊天记录、邮件等；
- 工资发放记录、考勤记录等辅助证明；
- 同事证言（如有）。
证据需形成完整链条，证明离职原因与公司所述“个人原因”不符。
与公司协商，书面提出异议
若公司拒绝口头修改，可向公司发送书面《异议函》，明确指出：
- 证明中“个人原因”与事实不符；
- 要求公司限期修正并重新出具证明；
- 保留追究法律责任的权利（如因证明错误导致您损失的，可要求赔偿）。
书面函件需留存送达凭证（如邮寄回执、签字确认等）。
向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁
若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉，或直接申请劳动仲裁，要求公司：
- 重新出具符合事实的离职证明；
- 若因错误证明导致您无法领取失业金、影响新工作入职等，可主张赔偿损失。
法律依据：
- 《劳动合同法》第五十条：用人单位应在解除或终止劳动合同时出具证明，并写明劳动合同期限、解除或终止日期、工作岗位、在本单位的工作年限。
- 第八十九条：用人单位违反规定未出具证明，或出具虚假证明的，由劳动行政部门责令改正；给劳动者造成损害的，应承担赔偿责任。
特殊情况处理
- 若公司拒不配合且您已入职新单位：可与新单位沟通说明情况，提供其他证据（如原公司同事证言、社保记录等）辅助证明离职原因。
- 若涉及诉讼：在劳动仲裁或法院诉讼中，公司需对其出具的证明真实性负责。若您能提供相反证据，仲裁委或法院通常不会采信公司单方面出具的虚假证明。
建议：处理此类问题时需保持冷静，优先通过协商解决，同时注意保留所有书面证据。若公司态度强硬，及时通过法律途径维权是有效手段。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作细节。