结论：在员工起诉单位，但工作、签合同、发工资为不同单位的情况下，起诉对象的选择需根据实际情况判断，一般可起诉与员工建立劳动关系的实际用人单位，若存在关联关系或混同用工情形，也可将相关单位列为共同被告。
详细分析：
劳动关系认定是关键：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，劳动关系是劳动者与用人单位之间在实现劳动过程中建立的社会经济关系。认定劳动关系时，主要考虑劳动者是否实际接受用人单位的管理、指挥或监督，劳动者提供的劳动是否是用人单位业务的组成部分，以及用人单位是否向劳动者提供基本劳动条件、支付劳动报酬等因素。
- 在您描述的情况下，尽管工作、签合同、发工资可能涉及不同单位，但关键在于确定哪个单位与员工建立了实际的劳动关系。通常，与员工签订劳动合同的单位会被视为用人单位，但如果实际用工情况与合同不符，如实际工作由另一单位安排、管理，且该单位也支付了部分或全部工资，则可能构成事实劳动关系。
起诉对象的选择：
- 单一用人单位情形：如果能够明确只有一个单位与员工建立了劳动关系，那么员工应直接起诉该单位。例如，如果合同虽然与A公司签订，但实际工作由B公司安排，且B公司支付工资，但A公司仍对员工进行一定程度的管理或监督，此时若能证明A公司为实际用人单位（如通过工作证、考勤记录、工作安排等证据），则起诉A公司。若证据显示B公司为实际用人单位，则起诉B公司。
- 关联关系或混同用工情形：如果多个单位之间存在关联关系（如母子公司、兄弟公司等），或者存在混同用工的情况（即多个单位共同使用同一劳动者，且难以区分劳动关系归属），员工可以将这些单位列为共同被告。在这种情况下，法院会综合考虑各单位之间的关联关系、用工情况、工资支付等因素，来判断哪个或哪些单位应承担法律责任。
法律建议：
- 收集证据：员工应尽可能收集与劳动关系相关的证据，如劳动合同、工作证、考勤记录、工作安排记录、工资支付记录等，以证明自己与哪个单位建立了劳动关系。
- 咨询律师：由于劳动关系认定和起诉对象选择涉及复杂的法律问题和证据收集，建议员工在起诉前咨询专业律师，以便更准确地判断起诉对象，并制定有效的诉讼策略。
- 考虑调解或仲裁：在起诉前，员工也可以考虑通过调解或仲裁等非诉讼方式解决纠纷，这通常可以更快地解决问题，并减少诉讼成本。
后续行动建议：
- 如果您或您身边的人遇到类似情况，建议首先收集相关证据，并尽快咨询专业律师以获取更具体的法律建议。
- 在起诉前，也可以考虑与对方单位进行协商或申请劳动仲裁，以尝试通过非诉讼方式解决纠纷。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律解答和建议。