公司停工不给员工发工资又不办理离职，员工可采取以下措施维护自身合法权益：

1. 与公司协商
   首先，员工可尝试与公司进行友好协商，明确表达诉求，要求公司支付拖欠的工资并办理离职手续。协商过程中，建议保留书面沟通记录（如邮件、微信聊天记录等），以备后续维权使用。若公司同意支付工资并办理离职，双方可签订书面协议，明确支付时间、金额及离职手续办理等事项。

2. 向劳动监察部门投诉
   若协商无果，员工可向当地劳动监察部门投诉。根据《劳动保障监察条例》的相关规定，劳动监察部门有权对公司进行调查，并责令公司限期支付拖欠的工资。投诉时，员工需提供与公司存在劳动关系的证明（如劳动合同、工资条、工作证等）以及公司拖欠工资的相关证据。

3. 申请劳动仲裁
   若劳动监察部门处理后，公司仍未支付工资或办理离职手续，员工可向当地劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。仲裁请求可包括要求公司支付拖欠的工资、经济补偿金（如符合法定情形）以及办理离职手续等。仲裁过程中，员工需提交充分的证据证明自己的主张，如工资支付记录、考勤记录、公司停工通知等。

4. 提起诉讼
   若对劳动仲裁结果不服，员工可在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。诉讼过程中，员工需继续提供证据支持自己的主张，并按照法院的要求参与庭审活动。若法院最终判决公司支付工资并办理离职手续，公司需履行判决义务，否则员工可申请强制执行。

特别提醒：

• 在整个维权过程中，员工需保持冷静，依法维权，避免采取过激行为导致自身权益受损。
  
• 保留好所有与公司相关的证据材料，包括劳动合同、工资条、考勤记录、公司通知等，以便在需要时提供证明。
  
• 若公司存在恶意拖欠工资、拒不办理离职手续等违法行为，员工还可向公安机关报案，追究公司的法律责任。