事业单位试用期设定为12个月，在特定条件下是合法的，但也存在不合法的情形。具体合法性取决于聘用合同的期限、员工的就业经历以及事业单位的性质等因素，以下是对此问题的详细分析：
一、合法情形
初次就业且合同期限3年以上：
- 根据《事业单位人事管理条例》第十三条的规定，对于初次就业的工作人员（主要指应届毕业生或首次进入事业单位工作的人员），若其与事业单位订立的聘用合同期限在3年以上，则试用期为12个月是符合法律规定的。
- 举例来说，如果一名应届毕业生与事业单位签订了为期5年的聘用合同，那么约定12个月的试用期就是合法的。
劳动合同法的相关规定：
- 参照《劳动合同法》的相关规定，若事业单位与员工签订的劳动合同期限为三年以上或无固定期限，那么约定12个月的试用期同样合法。
二、不合法情形
非初次就业人员：
- 对于非初次就业的人员，即已有就业经历的员工，事业单位与其约定的试用期通常会短于12个月。此时，若约定12个月试用期，则可能违反相关法律法规。
- 例如，一名已有多年工作经验的员工跳槽到事业单位，若事业单位与其约定12个月的试用期，这通常是不合法的。
合同期限不满3年：
- 即使员工是初次就业，但若其与事业单位签订的聘用合同期限不满3年，约定12个月的试用期也是不合法的。
- 举例来说，如果一名应届毕业生与事业单位签订了为期2年的聘用合同，那么约定12个月的试用期就违反了法律规定。
其他违规情况：
- 试用期的设定还需考虑事业单位的性质、与员工的协商情况以及其他相关劳动法规的遵守情况。例如，试用期内的工资、福利等不能低于法定标准。如果事业单位在试用期内未按照法律规定支付工资或提供福利，那么即使试用期本身设定为12个月，也可能因其他违规行为而被视为不合法。
三、综合判断与建议
- 在判断事业单位试用期设定的合法性时，应综合考虑聘用合同的期限、员工的就业经历、事业单位的性质以及相关法律法规的规定。
- 如果员工认为自己试用期被不合理对待，比如试用期过长、工资福利不达标等，可以直接向我咨询，我会根据具体情况为你提供专业的法律建议和帮助。
综上所述，事业单位试用期设定为12个月并非一概而论地合法或不合法，而是需根据具体情况进行判断。在签订聘用合同时，双方应明确约定试用期的长短，并确保其符合相关法律法规的规定。