结论：银行职工脑梗两年没上班，合同是否自动解除以及是否有补偿，需根据具体情况判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、合同解除情况
医疗期规定：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。脑梗作为严重疾病，职工应享有相应的医疗期。
- 若职工在医疗期内，用人单位不得解除劳动合同。医疗期满后，若职工仍不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。
自动解除合同的情况：
- 劳动合同不会因职工两年没上班而自动解除。合同的解除需遵循法定程序和条件，如双方协商一致、劳动者严重违反用人单位规章制度、劳动者不能胜任工作等。
- 若用人单位未按照法定程序解除劳动合同，而是单方面宣布合同解除，这可能构成违法解除，职工有权要求用人单位继续履行合同或支付赔偿金。
二、补偿情况
医疗期内的工资支付：
- 在医疗期内，用人单位应按照不低于当地最低工资标准的80%支付职工病假工资或疾病救济费。
经济补偿：
- 若用人单位合法解除劳动合同（如医疗期满后职工不能从事原工作或另行安排的工作），用人单位应按照职工在本单位的工作年限，每满一年支付一个月工资的标准向职工支付经济补偿。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向职工支付半个月工资的经济补偿。
- 若用人单位违法解除劳动合同，职工有权要求用人单位支付赔偿金，赔偿金为经济补偿的两倍。
特殊情况下的补偿：
- 若职工因脑梗导致残疾或丧失劳动能力，且符合相关条件，还可能享受工伤保险待遇，包括一次性伤残补助金、伤残津贴等。
三、建议与行动
核实医疗期：
- 职工应首先核实自己的医疗期是否已满，以及用人单位是否在医疗期内或医疗期满后按照法定程序解除了劳动合同。
收集证据：
- 职工应收集与劳动合同、医疗期、工资支付、解除合同通知等相关的证据，以备后续维权之需。
协商或诉讼：
- 若职工认为用人单位解除合同违法或未支付应得的补偿，可以与用人单位协商解决；协商不成的，可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，对仲裁裁决不服的，还可以向人民法院提起诉讼。
示例：假设某银行职工因脑梗住院治疗，医疗期为12个月。在医疗期内，用人单位未支付病假工资且医疗期满后未安排工作直接解除了劳动合同。此时，职工可以要求用人单位支付医疗期内的病假工资、经济补偿（若合法解除）或赔偿金（若违法解除），并可以通过劳动争议仲裁或诉讼途径维护自己的合法权益。
进一步思考：职工在面临此类情况时，应充分了解自己的权益和用人单位的义务，及时收集证据并寻求法律援助或咨询专业律师，以确保自己的合法权益得到有效维护。若您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。