结论：员工拒不退还公司多发的工资，在一般情况下是违法的，但具体是否违法及法律后果需结合实际情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、法律背景与原则
不当得利原则：
- 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，因他人没有法律根据，取得不当利益，受损失的人有权请求其返还不当利益。公司多发工资，员工没有合法依据取得这部分利益，构成不当得利，公司有权要求员工返还。
劳动法相关规定：
- 虽然《中华人民共和国劳动法》及《中华人民共和国劳动合同法》主要规范劳动合同的签订、履行、变更、解除和终止等，但并未直接规定多发工资的处理方式。然而，从劳动关系的公平性和诚实信用原则出发，员工应当返还多收的工资。
二、具体情况分析
员工是否知情：
- 如果员工在离职时或离职后不久即发现公司多发工资，并明知这部分工资不属于自己应得，却选择拒不退还，那么这种行为明显违反了不当得利原则，是违法的。
- 如果员工确实不知情，且在多年后公司才发现并要求退还，员工在得知情况后应当积极配合退还。但在此之前，员工并未构成故意违法。不过，一旦得知情况，拒不退还则构成违法。
公司追讨的时效性：
- 虽然法律对不当得利的追讨没有明确的时效限制（但需注意诉讼时效的一般规定，通常为三年，自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算），但公司应及时发现并追讨多发工资，以避免因时间过长导致证据灭失或员工拒不承认等情况。
- 如果公司多年后才发现并要求退还，员工可能会以“已过诉讼时效”或“不知情”等理由进行抗辩。但即便如此，从道德和公平角度出发，员工仍应退还多收的工资。
员工拒不退还的法律后果：
- 如果员工拒不退还多发工资，公司可以通过法律途径追讨，如向法院提起民事诉讼，要求员工返还不当得利。
- 在诉讼过程中，员工如果无法提供合法依据证明其有权取得这部分工资，法院将支持公司的诉讼请求，判决员工返还多发工资。
- 如果员工拒不执行法院判决，公司还可以申请强制执行，法院将采取相应措施强制员工履行还款义务。
三、建议与措施
对于公司：
- 应加强内部财务管理，确保工资发放的准确性和及时性，避免多发工资的情况发生。
- 一旦发现多发工资，应及时与员工沟通并要求退还，同时保留好相关证据以备法律追讨。
对于员工：
- 如果发现公司多发工资，应及时与公司沟通并说明情况，主动退还多收部分。
- 如果公司要求退还但员工认为存在争议或不知情，可以寻求法律援助或咨询专业律师以了解自己的权利和义务。
总结：员工拒不退还公司多发的工资，在一般情况下是违法的。公司有权要求员工返还不当得利，并可以通过法律途径追讨。员工应当遵守诚实信用原则，及时退还多收工资以避免法律纠纷。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。