核心结论：在对方企业因诉讼保全无法开出发票的情况下，付款方式需结合合同约定、法律规定及双方协商结果综合确定，以下分情况说明：

1. 合同有明确约定时的处理

• 优先按合同条款执行：若双方合同中已约定“发票开具与付款的先后顺序”（如“先票后款”或“先款后票”），或约定了“发票无法开具时的替代方案”（如以收据、付款证明等替代），则应按合同约定履行。
• 例外情形：若合同约定“先票后款”，但对方因诉讼保全客观上无法开具发票，且非其主观故意（如账户被冻结导致无法操作开票系统），可协商变更付款条件（如先支付部分款项，待发票开具后支付尾款）。

2. 合同无明确约定时的处理

• 法律依据：根据《民法典》第五百九十九条，出卖人未按约定交付标的物单证（如发票）的，买受人可拒绝支付对应价款，但需注意：
  • 发票与付款的关联性：若合同未将发票开具明确约定为付款前提条件，买受人不得仅以未开发票为由拒绝付款，否则可能构成违约。
  • 抗辩权行使：买受人可主张“同时履行抗辩权”或“先履行抗辩权”，但需证明发票开具与付款存在对等义务关系（如合同中隐含“付款前需提供发票”的交易习惯）。
• 实务建议：
  • 书面催告：要求对方限期开具发票，并保留催告证据（如邮件、函件）。
  • 协商替代方案：如对方确因诉讼保全无法开票，可协商以“收款确认书+税务机关代开发票”或“付款后保留追索权”等方式解决。

3. 对方拒不开票的救济途径

• 税务投诉：向当地税务机关举报对方未按规定开具发票，税务机关可责令其限期改正并处罚。
• 诉讼主张：在付款后，可单独起诉要求对方开具发票或赔偿因未开票导致的损失（如无法抵扣的税款、行政处罚损失等）。
• 合同条款设计建议：未来合同中可明确约定“发票开具为付款前提条件，逾期未开的，买方有权暂缓付款且不承担违约责任”，以降低风险。

4. 付款方式的具体操作

• 保留付款证据：无论采用何种方式付款，均需通过银行转账、第三方支付平台等可留痕的方式支付，并备注“货款”等用途，避免现金支付。
• 签订补充协议：若双方协商变更付款条件，需签订书面补充协议，明确付款时间、发票开具义务及违约责任。

提示：具体操作需结合合同条款、交易习惯及对方诉讼保全的具体情况（如保全范围、期限等）综合判断。如有争议，建议提供合同文本及保全裁定书等材料，进一步分析风险点。