不通过转账方式发放农民工资，本身并不直接构成违法，但若未以合法形式支付工资则可能违法。具体分析如下：

1. 支付形式与合法性
   根据《保障农民工工资支付条例》第十一条，农民工工资应当以货币形式，通过银行转账或者现金支付给农民工本人，不得以实物或者有价证券等其他形式替代。因此，若未通过转账或现金支付工资，而是以实物、有价证券等形式替代，则属于违法行为。

2. 支付记录与证据留存
   通过银行转账支付工资的优势在于，银行流水记录可作为工资发放的直接证据，便于劳动者维权。若采用现金支付，用人单位需承担举证责任，证明已足额支付工资（如签字确认的工资表、考勤记录等）。若无法提供充分证据，可能面临劳动监察部门的处罚或劳动仲裁中的败诉风险。

3. 未支付工资的法律后果
   若用人单位完全未支付工资（无论是否通过转账），则构成拖欠工资，违反《劳动法》第五十条及《劳动合同法》第三十条。劳动者可向劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁要求支付工资及经济补偿金。情节严重的，用人单位还可能面临行政处罚（如加付赔偿金）。

4. 特殊情形下的支付方式
   在特定情况下（如偏远地区无银行网点），经与劳动者协商一致，可暂时采用现金支付，但需确保劳动者签字确认并妥善保存记录。长期以现金支付且未留存证据的，仍可能被认定为违法。

建议：

• 用人单位应优先通过银行转账支付工资，并保留转账记录；
  
• 若采用现金支付，需劳动者签字确认工资表，并注明“已足额领取当月工资”；
  
• 劳动者若未收到工资，可先与用人单位协商，协商不成可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程或证据留存方法。