结论：16岁进厂工作本身是合法的，但企业必须严格遵守相关法律法规，给予未成年工特殊的劳动保护，否则将面临法律责任。以下从企业合法用工的角度，详细阐述企业应如何做以及不合法的情形有哪些：
企业合法用工应采取的措施
核查身份与年龄：
- 企业招用人员时，必须核查被招用人员的身份证，确保招用的是已满16周岁的未成年工，而非未满16周岁的童工。对不满16周岁的未成年人，一律不得录用。
提供特殊劳动保护：
- 根据《劳动法》第五十八条，国家对未成年工实行特殊劳动保护。企业应确保未成年工的工作环境安全、健康，避免安排他们从事矿山井下、有毒有害、国家规定的第四级体力劳动强度的劳动以及其他禁忌从事的劳动。
- 企业应定期对未成年工进行健康检查，确保他们的身体状况适合所从事的工作。
合理安排工作时间与劳动强度：
- 企业应合理安排未成年工的工作时间和劳动强度，避免过度劳累，保障他们的身心健康。
保障接受义务教育的权利：
- 如果未成年工仍在接受义务教育阶段，企业应确保他们有足够的时间完成学业，不得因工作而影响其受教育权。
企业不合法的情形及后果
招用未满16周岁的未成年人：
- 根据《禁止使用童工规定》，用人单位招用未满16周岁的未成年人，将面临劳动保障行政部门的处罚，包括罚款、责令限期改正等。情节严重的，还可能被吊销营业执照。
未提供特殊劳动保护：
- 如果企业未对未成年工提供特殊劳动保护，如安排他们从事禁忌劳动、未定期进行健康检查等，将违反《劳动法》的相关规定，可能面临劳动保障行政部门的警告、罚款等处罚。
侵犯未成年工的其他权益：
- 如果企业侵犯未成年工的其他合法权益，如拖欠工资、未签订劳动合同等，也将面临相应的法律责任。未成年工可以通过劳动争议仲裁或诉讼等途径维护自己的权益。
实际案例与法律建议
- 实际案例：某企业因招用未满16周岁的未成年人被劳动保障行政部门查处，不仅被罚款，还因影响恶劣被吊销了营业执照。这一案例警示企业必须严格遵守法律法规，不得招用童工。
- 法律建议：企业在招用未成年工时，应严格核查其身份和年龄，确保符合法律规定。同时，企业应建立完善的劳动保护制度，为未成年工提供安全、健康的工作环境。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议。
总之，企业招用已满16周岁的未成年工是合法的，但必须严格遵守相关法律法规，给予他们特殊的劳动保护。如有任何违法违规行为，企业将面临严重的法律后果。