结论：水利局二级机构在周末安排防汛值班且不给予调休是否合法，需分情况讨论，主要取决于值班性质是否属于“加班”以及单位是否依法支付加班工资或安排补休。以下是具体分析：

1. 若值班属于“加班”且未安排补休或支付加班工资，则不合法

根据《劳动法》第四十四条：

• 休息日加班：若值班安排在周六、周日（休息日），且劳动者无法安排补休的，单位应支付不低于工资200%的加班工资。
• 法定休假日加班：若值班涉及法定节假日（如国庆、春节等），单位需支付不低于工资300%的加班工资，且不得以调休替代。

关键点：

• 若单位既未安排调休，也未支付加班工资，则违反《劳动法》，劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
• 防汛值班若属于“紧急任务”或“特殊职责”，仍需遵循上述加班工资支付规则。

2. 若值班属于“值班”而非“加班”，则可能合法

实践中，部分单位将“值班”与“加班”区分：

• 值班：通常指单位因安全、消防、防汛等需要，安排劳动者从事非生产性任务（如巡查、待命），工作时间可能较短或强度较低。
• 加班：指劳动者在正常工作时间外继续从事本职工作或单位安排的生产任务。

法律差异：

• 若认定为“值班”，单位可能无需支付加班工资，但需根据地方规定或内部制度给予适当补助（如调休、津贴）。
• 但需注意：若值班实际工作内容与正常工作无异（如防汛期间全程在岗处理事务），仍可能被认定为“加班”，需支付加班工资。

3. 建议行动步骤

1. 核实值班性质：

   • 查看单位规章制度或劳动合同中是否明确区分“值班”与“加班”。
   • 记录值班具体工作内容、时长及强度，判断是否属于本职工作延伸。

2. 与单位协商：

   • 要求单位明确值班性质，并主张调休或加班工资。
   • 保留值班记录、排班表等证据。

3. 维权途径：

   • 若协商无果，可向当地劳动监察大队投诉（电话：12333）。
   • 申请劳动仲裁，主张加班工资或补休（需在1年内提出）。

温馨提示：防汛值班属于公共利益范畴，但单位仍需依法保障劳动者权益。若您需进一步分析具体证据或维权策略，可随时向我咨询。