结论：小民企在签订合同时，通常不应扣押员工的毕业证，且这种行为可能涉及违法。

分析角度一：法律规定

1. 毕业证的性质：毕业证是个人学历的证明，属于个人财产的一部分，受到法律保护。根据《中华人民共和国劳动合同法》第九条的规定，用人单位招用劳动者，不得扣押劳动者的居民身份证和其他证件，不得要求劳动者提供担保或者以其他名义向劳动者收取财物。这里的“其他证件”可以广义理解为包括毕业证在内的各类能证明个人身份或资质的证件。

2. 违法后果：如果小民企在签订合同时扣押员工的毕业证，可能面临行政处罚，如由劳动行政部门责令限期退还劳动者本人，并可能处以罚款。同时，这种行为也可能影响企业的声誉和员工的忠诚度，对企业的长期发展不利。

分析角度二：实际操作与风险

1. 实际操作中的问题：扣押毕业证在实际操作中可能带来诸多不便。例如，员工在需要毕业证进行其他事务办理时（如继续深造、职称评定等），会因毕业证被扣押而受到影响。这可能导致员工对企业产生不满，甚至引发劳动纠纷。

2. 风险防控：对于小民企而言，扣押毕业证并非一种有效的风险防控手段。企业可以通过签订详细的劳动合同、明确双方的权利和义务、建立完善的员工管理制度等方式来降低用工风险。扣押毕业证不仅无法真正解决问题，反而可能引发更多的法律风险和纠纷。

分析角度三：员工权益保护

1. 员工权益：员工有权保护自己的个人财产和隐私不受侵犯。毕业证作为个人学历的证明，是员工的重要财产之一。企业无权扣押员工的毕业证，否则将侵犯员工的合法权益。

2. 维权途径：如果员工发现企业扣押了自己的毕业证，可以通过与用人单位协商、向劳动行政部门投诉、申请劳动争议仲裁或提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。

建议：

• 对于小民企而言，应遵守相关法律法规，不得扣押员工的毕业证或其他证件。
• 企业可以通过其他合法手段来降低用工风险，如完善员工管理制度、加强员工培训等。
• 员工在发现企业扣押毕业证等违法行为时，应及时采取措施维护自己的合法权益。

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