生病不能上班，公司不一定要扣工资，具体要看情况。以下是从不同角度为你详细分析：
一、病假与工资支付的一般规定
根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》以及相关劳动法律法规，员工因病或非因工负伤需要停止工作医疗时，企业应当根据员工本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予一定的医疗期。在医疗期内，企业应当按照规定支付员工病假工资或者疾病救济费，且不得低于当地最低工资标准的80%。
举例说明：假设某员工在某公司工作已满5年，根据规定，他享有3个月的医疗期。在这3个月内，即使他因病不能上班，公司也应当按照不低于当地最低工资标准80%的比例支付他病假工资。
二、特殊情况下的工资支付
医疗期满后的处理：如果员工医疗期满后仍不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，用人单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同。但在此之前，如果员工仍在医疗期内，公司不得随意解除劳动合同，且应当继续支付病假工资。
员工未履行请假手续：如果员工因病不能上班，但未按照公司规定履行请假手续，公司可能会根据内部规章制度对其作出相应处理，包括扣发工资等。但这种情况下的处理应当合理且合法，不能违反劳动法律法规的强制性规定。
三、公司扣工资的合法性判断
查看公司规章制度：首先，你需要查看公司的规章制度中是否有关于病假工资支付的规定。如果公司规章制度中明确规定了病假工资的支付方式和标准，且该规定不违反劳动法律法规的强制性规定，那么公司按照规章制度执行是合法的。
判断公司行为是否合理：如果公司规章制度中没有明确规定病假工资的支付方式和标准，或者规定违反了劳动法律法规的强制性规定，那么公司随意扣发工资的行为可能是不合法的。在这种情况下，你可以与公司协商解决，或者向劳动监察部门投诉举报。
四、建议与行动
与公司沟通：如果你因病不能上班且担心工资问题，建议首先与公司的人力资源部门或相关负责人进行沟通，了解公司的病假工资支付政策和规定。
保留证据：在沟通过程中，记得保留好相关证据，如病假条、医疗证明、工资条等，以备不时之需。
寻求法律帮助：如果你认为公司的行为违反了劳动法律法规或者公司规章制度中的规定，且无法与公司协商解决，可以寻求法律帮助，比如向我咨询或者向当地的劳动监察部门投诉举报。
总之，生病不能上班时，公司是否扣工资取决于多种因素，包括医疗期、公司规章制度以及你的请假手续等。如果你对此有疑问或者遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。