结论：在此情况下，工人通常与有资质的劳务公司具有劳动关系，而非与无用工主体资格的个人。

分析说明：

1. 劳动关系的认定原则：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，劳动关系的认定主要基于劳动者与用人单位之间是否存在事实上的劳动管理关系，包括劳动者是否接受用人单位的管理、指挥和监督，以及劳动者提供的劳动是否是用人单位业务的组成部分等。

2. 违法分包的情况：

   • 当有资质的劳务公司将工程违法分包给无用工主体资格的个人时，这种分包行为本身是违法的。无用工主体资格的个人不具备与劳动者建立劳动关系的法定条件。
   • 在此情况下，尽管工人可能是由无用工主体资格的个人直接招聘和管理，但从法律角度上看，这种管理关系并不构成合法的劳动关系。因为无用工主体资格的个人无法承担劳动关系中的用人单位责任。

3. 劳务公司的责任：

   • 有资质的劳务公司作为工程的合法承包方，对工程的施工和管理负有法律责任。当其将工程违法分包给无用工主体资格的个人时，实际上是将本应由其承担的劳动管理责任转嫁给了不具备相应资质的个人。
   • 根据劳动法的相关规定和司法实践，有资质的劳务公司应被视为与工人存在劳动关系，并承担相应的用人单位责任。这包括支付工资、提供劳动保护、缴纳社会保险等。

4. 实际案例与司法实践：

   • 在实际案例中，法院通常会根据劳动关系的认定原则，结合违法分包的具体情况，判决有资质的劳务公司与工人存在劳动关系，并要求其承担相应的法律责任。
   • 司法实践也倾向于保护劳动者的合法权益，防止用人单位通过违法分包等方式逃避法律责任。

特殊情况说明：

• 如果工人能够证明其与无用工主体资格的个人之间存在明确的雇佣关系，并且这种关系符合劳动关系的某些特征（如长期、稳定、接受管理等），但在法律上，由于个人不具备用工主体资格，这种关系仍不被认定为合法的劳动关系。工人仍应向有资质的劳务公司主张权利。

建议与行动：

• 对于工人而言，如果遇到此类情况，应首先收集相关证据（如工作证、工资条、工作记录等），以证明其与有资质的劳务公司之间存在事实上的劳动关系。
• 然后，可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求确认劳动关系并主张相应的权益。
• 如有需要，也可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。