总公司起诉分公司负责人需分情况讨论，核心结论取决于分公司性质及债务性质，具体分析如下：

1. 若分公司为非法人分支机构（常见情形）

   • 法律关系：分公司不具有独立法人资格，其民事责任由总公司承担（《公司法》第14条）。此时总公司起诉分公司负责人可能涉及两种法律逻辑：
     
     • 表见代理或职务行为纠纷：若负责人以分公司名义对外签署合同或举债，但超出授权范围导致总公司损失，总公司可主张负责人赔偿（需证明负责人存在故意或重大过失）。
       
     • 内部责任追偿：若债务本质属于总公司债务（如总公司指令分公司借款），但通过分公司账户走账，起诉负责人可能缺乏法律依据，除非能证明负责人私自挪用资金。
       
   • 关键证据：需提供授权委托书、内部财务制度、资金流向证明等，区分“职务行为”与“个人行为”。

2. 若分公司为独立核算的非法人分支机构

   • 特殊情形：部分企业通过内部协议约定分公司独立核算，但法律上仍不改变其非法人地位。此时总公司起诉负责人可能涉及：
     
     • 违反内部管理规定：如负责人未按协议上缴利润或违规操作导致总公司损失，可依据《民法典》第170条（职务代理）或内部协议追责。
       
     • 注意风险：若总公司试图通过起诉负责人转移债务，可能被法院认定为“滥用权利”，导致诉讼目的落空。

3. 若债务实际为负责人个人债务

   • 常见误区：总公司需严格区分“分公司债务”与“负责人个人债务”。例如：
     
     • 负责人以个人名义借款但用于分公司经营，需证明资金实际用途（如银行流水、证人证言），否则可能被认定为个人债务。
       
     • 若总公司误将个人债务列为分公司债务起诉，负责人可主张“主体不适格”抗辩。

实务建议：

• 步骤1：立即委托律师调取分公司工商档案，确认其是否领取营业执照及核算方式（独立/非独立）。
  
• 步骤2：梳理债务形成过程（合同签署主体、资金流向、内部审批记录），固定关键证据。
  
• 步骤3：评估诉讼策略：若需追责负责人，优先以“损害公司利益责任纠纷”或“职务侵占罪”（刑事）立案；若需解决债务，应直接起诉债务实际承担方（可能是总公司、分公司或第三方）。
  

风险提示：总公司起诉分公司负责人可能引发内部管理矛盾，建议同步评估是否需通过股东会决议、审计程序等内部治理手段解决问题。如有进一步细节（如债务金额、合同文本），可提供后为您定制诉讼方案。