关于您在公司干了5年，今年体检查出肺气肿，公司是否有赔偿义务的问题，首先需要明确的是，肺气肿是否属于工伤，以及是否与工作有直接关联。以下是我根据您的情况，结合相关法律法规进行的详细分析：
工伤认定：
- 工伤通常指的是在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害或患职业病。
- 肺气肿是否属于工伤，需要看其是否与工作有直接因果关系。例如，如果肺气肿是由于长期接触某种职业性有害因素（如粉尘、化学物质等）导致的，且这种有害因素是工作特有的，那么可能构成工伤。
- 如果肺气肿并非由工作直接导致，而是由于个人生活习惯、遗传等因素引起的，那么通常不被认定为工伤。
赔偿问题：
- 如果肺气肿被认定为工伤，那么您有权根据《工伤保险条例》等相关法律法规，享受工伤保险待遇，包括医疗费用、康复费用、停工留薪期间的工资福利等。
- 如果肺气肿未被认定为工伤，但您认为公司的工作环境或工作条件对您的健康造成了影响，您可以考虑通过民事途径（如提起健康权纠纷诉讼）来寻求赔偿。不过，这需要您提供充分的证据来证明公司存在过错，以及这种过错与您的肺气肿之间有直接的因果关系。
建议：
- 首先，建议您尽快咨询专业的医疗机构，明确肺气肿的病因和病情。
- 如果认为肺气肿可能与工作有关，可以向当地的社会保险行政部门提出工伤认定申请，并按照要求提交相关材料。
- 如果工伤认定申请被驳回，或者您希望通过民事途径寻求赔偿，可以咨询我这样的专业律师，以便更好地维护您的合法权益。
综上所述，公司是否有赔偿义务，取决于肺气肿是否属于工伤以及是否与工作有直接关联。建议您根据具体情况，采取适当的法律措施来维护自己的权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。