结论：失业保险金未领取部分在第二年发放给公司的做法通常不合法，但需结合具体情况分析。以下从不同角度展开说明：

1. 失业保险金的性质与归属

根据《社会保险法》和《失业保险条例》，失业保险金是参保人因非本人意愿中断就业后，由失业保险基金支付的临时生活补助，所有权属于失业人员本人。公司无权代领或截留，即使员工未及时申领，未领取的金额也应保留在失业保险基金中，而非转归公司。

2. 可能的例外情形

若存在以下情况，公司可能涉及合法操作，但需严格符合法律程序：

• 员工书面授权：员工明确签署授权文件，委托公司代为办理申领手续，并指定资金用途（如抵扣欠薪、赔偿等）。但即使如此，公司也需将款项实际支付给员工，而非自行留存。
• 法院判决或仲裁裁决：若员工与公司存在劳动争议，法院或仲裁机构裁定将未领取的失业保险金用于抵偿员工对公司的债务（如培训费、违约金等），公司可依法执行。但此类情形极为特殊，需以生效法律文书为依据。
• 地方性政策差异：极少数地区可能出台临时性政策（如疫情期间），允许企业申请稳岗补贴或失业保险稳岗返还，但这类资金与员工个人失业保险金性质不同，需以当地人社部门文件为准。

3. 公司的常见违法操作

若公司未经员工同意，擅自将未领取的失业保险金截留或用于其他用途，可能涉及以下违法行为：

• 侵犯财产权：失业保险金属员工个人财产，公司无权占有。
• 未依法缴纳社会保险：若公司未及时为员工办理失业保险申领手续，导致员工无法领取，可能违反《社会保险法》第60条，面临行政处罚。
• 劳动争议风险：员工可依据《劳动合同法》第38条，以“未依法为劳动者缴纳社会保险费”为由解除劳动合同，并主张经济补偿。

4. 员工维权建议

若遇到此类情况，可采取以下步骤：

• 与公司协商：要求公司出具未领取失业保险金的明细及处理依据。
• 向社保部门投诉：携带劳动合同、离职证明等材料，向当地人社局社保中心举报公司截留行为。
• 申请劳动仲裁：若涉及经济纠纷，可主张公司返还失业保险金或赔偿损失。

提示：失业保险政策存在地域差异，建议结合您所在省份的具体规定进一步核实。如有疑问，可直接向我提供更多细节（如所在地区、公司具体操作方式等），我会为您进一步分析。