公司不可以仅以员工患有幽门螺旋杆菌为由开除员工。以下从几个角度详细分析这一问题：

1. 幽门螺旋杆菌的性质与劳动法保护

幽门螺旋杆菌是一种常见的胃部细菌，虽然它可能引发胃炎、胃溃疡等疾病，但并不属于《中华人民共和国劳动合同法》中规定的用人单位可以解除劳动合同的法定情形。根据劳动法，用人单位解除劳动合同必须基于合法的理由，如员工严重违反公司规章制度、不能胜任工作且经过培训或调岗后仍不能胜任、严重失职或营私舞弊给公司造成重大损害等。单纯因为员工患有幽门螺旋杆菌，并不构成用人单位解除劳动合同的合法依据。

1. 医疗期与解除劳动合同的限制

如果员工因幽门螺旋杆菌引发疾病需要治疗，且符合医疗期的相关规定，那么在医疗期内，用人单位不得解除劳动合同。医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限。在医疗期内，员工享有病假工资或疾病救济费，且用人单位不得随意解除劳动合同。

1. 歧视与平等就业权

用人单位不得因员工患有某种疾病（除非该疾病属于法律规定的职业病或传染病，且可能对他人健康造成威胁）而对其进行歧视或解除劳动合同。幽门螺旋杆菌并不属于法律规定的职业病或传染病范畴，因此，用人单位仅以此为由开除员工，可能构成对员工平等就业权的侵犯。

1. 可能的法律后果

如果用人单位违反上述规定，仅以员工患有幽门螺旋杆菌为由开除员工，员工有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位继续履行劳动合同或支付违法解除劳动合同的赔偿金。赔偿金的标准通常为经济补偿金的两倍，经济补偿金则根据员工在用人单位的工作年限和月工资水平来确定。

建议：

• 对于员工而言，如果遭遇此类情况，应保留好相关证据（如劳动合同、解除劳动合同通知书、医疗证明等），并及时向劳动争议仲裁委员会申请仲裁以维护自己的合法权益。
• 对于用人单位而言，应严格遵守劳动法律法规的规定，不得随意解除劳动合同。在处理员工健康问题时，应遵循合法、合理、公正的原则，避免侵犯员工的合法权益。

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