在实行综合计算工时工作制的企业中，关于“三薪延时”（即法定节假日工作时的三倍工资以及平时延长工作时间的加班工资计算）的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解析：

一、综合计算工时工作制的基本概念

综合计算工时工作制是一种特殊的工时制度，它允许企业在一定周期（如周、月、季、年）内灵活安排工作时间。但重要的是，整个周期内的平均工作时间和平均周工作时间应与法定标准工作时间基本相同。这种制度特别适用于那些因工作性质特殊，需要连续作业、受季节影响或自然条件限制的企业或岗位。

二、计算周期与法定标准工作时间的确定

1. 计算周期：企业可以根据实际情况选择周、月、季或年作为计算周期，但这一选择需要报劳动保障行政部门审批。

2. 法定标准工作时间：

   • 年法定标准工作时间为2000小时（已扣除休息日和法定假日）。
   • 月制度工作天数通常为21.75天，每天8小时，即月正常工作小时数为174小时。
   • 季度和年的法定标准工作时间则相应乘以月份或季度数。

三、延长工作时间的认定与加班工资的计算

1. 延长工作时间的认定：在综合计算周期内，如果职工的实际工作时间超过了该周期的法定标准工作时间总数，那么超出部分就被认定为延长工作时间。

2. 加班工资的计算：

   • 平时延长工作时间：用人单位安排劳动者在正常工作时间以外延长工作时间的，应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人小时工资标准的150%支付加班工资。
   • 法定节假日工作：无论整个周期内的总工作时间是否超过法定标准时间，只要劳动者在法定节假日工作，都应按照不低于劳动合同规定的劳动者本人日或小时工资标准的300%支付加班工资。这就是我们通常所说的“三薪”。

四、延长工作时间的限制

为了保障劳动者的休息权，综合计算工时工作制对延长工作时间也设定了限制：

• 以年为周期时，延长工作时间累计不得超过432小时。
• 以季为周期时，延长工作时间累计不得超过108小时。
• 以月为周期时，延长工作时间累计不得超过36小时。
• 以周为周期时，直接以40小时为单位计算，延长工作时间累计不得超过8小时。

同时，企业必须保证职工在每个周期内至少休息一定天数，如年以52天、季以13天、月以4天、周以1天为基准。

五、实例说明

假设某企业采用以季度为周期的综合计算工时工作制，某职工在季度内实际工作了600小时，而该季度的法定标准工作时间为522小时（174小时/月×3月）。那么，该职工本季度的加班时间为78小时（600小时-522小时）。这78小时中，如果包含了法定节假日的工作时间，那么这部分时间应按照300%的标准支付加班工资；其余部分则按照150%的标准支付加班工资。

综上所述，企业在实行综合计算工时工作制时，应严格遵守相关法律法规，合理安排工作时间，确保劳动者的合法权益得到保障。对于延长工作时间的计算及加班工资的支付，企业应严格按照规定执行，以避免法律风险和经济纠纷的发生。