您好，关于您提出的“申请回避后移交案卷怎么处理”的问题，这是一个涉及法律程序和制度规定的重要问题，我会为您详细解答。
首先，我们需要明确回避制度的基本概念和目的。回避制度是为了确保案件处理的公正性和客观性而设立的一项重要制度。当审查调查审理人员与案件存在某种利害关系，或者可能影响公正处理案件时，他们应当主动申请回避，或者被相关人员要求回避。这是为了防止因人情、利益等因素影响监督执纪工作，确保纪检监察干部能够秉公用权、公正用权。
接下来，针对您提出的问题，当审查调查审理人员申请回避后，案卷的处理应当遵循以下原则：
及时移交：一旦审查调查审理人员申请回避并得到批准，他们应当立即将所掌握的案卷材料、证据等移交给接手的同事或上级部门。这是为了确保案件处理的连续性和不间断性，防止因人员变动而导致案件处理受阻。
确保完整性：在移交案卷时，审查调查审理人员应当确保案卷的完整性和准确性。他们应当详细记录案卷中的每一份材料、每一个证据，并确保这些材料和证据在移交过程中不丢失、不损坏。
保密性：在移交案卷的过程中，审查调查审理人员应当严格遵守保密规定，确保案卷中的敏感信息不被泄露。他们应当采取必要的保密措施，如加密传输、专人送达等，以确保案卷的安全。
接手人员的资质：接手案卷的人员应当具备相应的资质和经验，能够胜任案件的处理工作。他们应当熟悉相关法律法规和程序规定，确保案件能够得到公正、客观的处理。
监督与记录：整个移交过程应当受到监督，并留下详细的记录。这有助于确保移交过程的透明性和可追溯性，防止出现任何不当行为或疏漏。
此外，我还想补充一点，即在实际操作中，如果审查调查审理人员因回避而无法继续参与案件处理，相关部门应当及时安排其他合适的人员接手案件，并确保接手人员能够充分了解案件情况，继续推进案件处理工作。
最后，我想强调的是，回避制度是确保案件处理公正性和客观性的重要保障。当审查调查审理人员申请回避时，相关部门应当严格按照规定处理案卷移交等事宜，确保案件能够得到公正、客观的处理。
希望以上解答能够对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的解释和说明，请随时告诉我。