结论：员工工资总额不变，仅底薪变更是否违法，需根据具体情况判断。若底薪降低但通过其他形式（如奖金、津贴）补足，且符合劳动合同约定及法律规定，则不违法；若底薪降低导致员工权益受损，且未经合法程序变更劳动合同，则可能违法。
分析如下：
劳动合同的约定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。劳动合同中通常会约定员工的工资构成，包括底薪、奖金、津贴等。
- 如果劳动合同中明确规定了底薪的数额，且未允许用人单位单方面变更，那么用人单位未经员工同意擅自降低底薪，即使通过其他形式补足工资总额，也可能构成违约。
工资构成的合法性：
- 工资总额不变，仅底薪变更，关键在于变更后的工资构成是否合法。如果底薪降低，但通过增加奖金、津贴等方式补足，且这些增加的部分符合法律法规和劳动合同的约定，那么这种变更可能是合法的。
- 然而，如果底薪的降低导致员工的基本生活保障受到影响，或者用人单位通过变更工资构成来规避法律义务（如减少社保缴纳基数等），则这种变更可能是违法的。
变更劳动合同的程序：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同，应当采用书面形式。
- 如果用人单位未经员工同意擅自变更底薪，即使工资总额不变，也可能因违反法定程序而构成违法。员工有权要求用人单位恢复原底薪或采取其他补救措施。
法律建议：
- 对于员工：如果发现用人单位擅自变更底薪，应首先查看劳动合同中的相关约定，并了解变更后的工资构成是否合法。如果认为自己的权益受到侵害，可以与用人单位协商解决；协商不成的，可以向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 对于用人单位：在变更员工工资构成时，应确保变更后的工资构成合法、合理，并符合劳动合同的约定。同时，应遵循法定程序，与员工协商一致并采用书面形式变更劳动合同。
可能法律后果：
- 如果用人单位擅自变更底薪且未经合法程序，可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令改正、罚款等。
- 员工因此遭受损失的，用人单位还可能承担赔偿责任。
如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。