结论：公司不续签劳动合同的赔偿金，通常是按照劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资来计算的，这个平均工资是应发工资，而非仅到手工资。不过，具体计算还需考虑月工资是否高于当地职工月平均工资三倍等特殊情况。
详细分析：
月工资基数的确定：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，经济补偿金是按照劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资来计算的。这里的“平均工资”指的是应发工资，即包括基本工资、奖金、津贴、补贴等所有货币性收入，在扣除社保、公积金、个税等之前数额，而非仅指劳动者实际到手的工资。
- 如果劳动者的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，那么经济补偿金将按照这个三倍数额来支付，且支付经济补偿的年限最高不超过十二年。
- 如果劳动者的月工资低于当地最低工资标准的，则按当地最低工资标准来计算经济补偿金。
工作年限的计算：
- 经济补偿金还与劳动者在本单位的工作年限有关。每满一年，用人单位需要支付一个月工资的经济补偿；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，支付半个月工资的经济补偿。
特殊情况下的处理：
- 如果用人单位维持或者提高劳动合同约定条件续订劳动合同，而劳动者不同意续订的，那么用人单位无需支付经济补偿金。
- 如果劳动者符合签订无固定期限劳动合同的条件，并请求续签，但用人单位拒绝续签的，这属于违法行为。此时，用人单位需要向劳动者支付赔偿金，即工作满一年者，需支付两个月的工资作为赔偿。
计算公式与示例：
- 假设劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资为8000元（应发工资），且在本单位工作了5年，那么经济补偿金的计算公式为：\(经济补偿金 = 工作年限 \times 月工资 = 5 \times 8000 = 40000元\)。
- 如果劳动者的月工资高于当地职工月平均工资的三倍，比如当地职工月平均工资为5000元，三倍即为15000元，而劳动者的月工资为20000元，那么经济补偿金将按照15000元来计算，且如果劳动者工作了10年以上，支付经济补偿的年限也最高不超过十二年。
建议与注意事项：
- 公司在决定不续签劳动合同时，应提前告知员工，并确保经济补偿金的计算准确无误，及时支付给劳动者。
- 劳动者在收到经济补偿金时，也应核对自己的工作年限和月工资标准，确保自己的合法权益不受损害。
- 如果对经济补偿金的计算有疑问或争议，建议及时咨询专业律师或劳动仲裁机构，以维护自己的合法权益。
希望以上分析能对你有所帮助，如果有任何法律问题，都可以直接向我咨询。