关于劳动争议案件中提成、加班费、被克扣工资以及未休年休假工资的时效问题，结论如下：

1. 提成与加班费的时效：

   • 一般规定：根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。这意味着，如果员工发现自己的提成或加班费被克扣，应当在这一年内向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以维护自己的权益。
   • 特殊情况：如果劳动关系存续期间因拖欠劳动报酬发生争议，且员工在劳动关系终止后一年内提出仲裁申请，那么这一年的时效期间从劳动关系终止之日起计算。但需要注意的是，这里的“劳动报酬”通常指的是基本工资，对于提成和加班费是否完全适用此条款，可能需要根据具体情况和地方司法实践来判断。不过，在大多数情况下，提成和加班费作为劳动报酬的一部分，也倾向于适用这一特殊规定，但为确保权益，建议尽早申请仲裁。

2. 被克扣工资的时效：

   • 被克扣工资同样适用上述《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定。员工应在发现工资被克扣后的一年内，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。如果因不可抗力或其他正当理由耽误了时效，可以在障碍消除后的十日内申请顺延时效。

3. 未休年休假工资的时效：

   • 一般理解：未休年休假工资虽然带有“工资”二字，但其性质更接近于一种福利待遇或补偿，而非直接的劳动报酬。因此，其时效问题可能不完全等同于基本工资或加班费的时效。然而，在司法实践中，未休年休假工资的争议也通常被纳入劳动争议的范畴，并适用一年的仲裁时效。
   • 具体计算：未休年休假工资的仲裁时效同样从员工知道或应当知道其权利被侵害之日起计算。如果员工在当年未休年休假且未获得相应补偿，那么从次年的1月1日起，员工就应当知道自己的权利可能受到了侵害，并应在一年的时效期间内申请仲裁。

法律建议：

• 对于提成、加班费、被克扣工资以及未休年休假工资的争议，员工应尽早收集相关证据，如工资条、考勤记录、劳动合同等，以证明自己的权益受到了侵害。
• 在发现权益受到侵害后，员工应及时向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，以免错过时效期间。
• 如果对仲裁结果不满，员工还可以在收到仲裁裁决书之日起十五日内向人民法院提起诉讼。

可能后果：

• 如果员工未能在时效期间内申请仲裁或提起诉讼，那么其可能失去通过法律途径维护自己权益的机会。
• 即使员工申请了仲裁或提起了诉讼，如果证据不足或无法证明自己的权益受到了侵害，那么其也可能面临败诉的风险。

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