关于“上班迟到1分钟要扣全勤奖吗”的问题，结论并非绝对，而是取决于多个因素，包括劳动合同、规章制度的内容及其合法性、合理性等。以下从不同角度进行详细分析：
从劳动合同和规章制度的角度：
- 有明确约定：如果劳动合同、员工手册或规章制度中明确规定了迟到即扣除全勤奖，且该规定已经过法定的民主程序制定（如经职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定）并进行了公示或告知劳动者，那么用人单位有权依据该规定扣除全勤奖。例如，员工手册中明确规定“当月出现任何迟到、早退情况的，不发放全勤奖”，此时用人单位扣除全勤奖具有明确依据。
- 约定不明确或未约定：若劳动合同、员工手册或规章制度中对全勤奖的定义、发放条件，特别是迟到与全勤奖的关系没有清晰界定，或者根本没有相关规定，用人单位则不能随意以迟到为由扣除全勤奖。在这种情况下，扣除全勤奖缺乏足够依据，员工有权提出质疑并要求支付全勤奖。
从合法性和合理性的角度：
- 合法性：用人单位制定的规章制度必须符合国家法律法规的规定，不能违反法律强制性规定或排除劳动者的合法权益。如果规章制度中的迟到扣全勤奖规定违反了相关法律法规的精神，如排除了劳动者的合法权益，则该规定可能会被认定为无效。
- 合理性：规章制度的内容应当合理合法，不能明显不合理。例如，将轻微迟到（如1分钟）即视为严重违规并扣除全勤奖，这样的规定可能会被认定为过于苛刻，缺乏合理性，从而不被法律支持。在实际操作中，应考虑迟到的具体情形，对于偶尔迟到且有合理原因（如突发交通意外、身体不适等）的员工，用人单位可以酌情考虑不扣除全勤奖，体现人性化管理。
从员工权益保护的角度：
- 沟通协商：如果员工认为用人单位扣除全勤奖的做法不合理或不合法，首先应与用人单位进行沟通协商，要求其说明扣奖依据，并尝试达成共识。
- 投诉与仲裁：若协商不成，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在投诉或仲裁过程中，员工需提供充分的证据来支持自己的主张，如劳动合同、员工手册、规章制度、考勤记录等。
应对建议：
- 审查规章制度：员工应仔细审查用人单位的规章制度，了解其中关于全勤奖和迟到的规定，确保自己的权益不受侵害。
- 保留证据：在日常工作中，员工应保留好与考勤、工资等相关的证据，以备不时之需。
- 积极维权：如果员工认为自己的权益受到侵害，应积极与用人单位沟通协商，并在必要时通过法律途径维护自己的合法权益。
法律依据：
- 《中华人民共和国劳动合同法》第四条：用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
- 《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》第五十条：用人单位根据劳动合同法第四条规定，通过民主程序制定的规章制度，不违反国家法律、行政法规及政策规定，并已向劳动者公示的，可以作为确定双方权利义务的依据。用人单位制定的内部规章制度与集体合同或者劳动合同约定的内容不一致，劳动者请求优先适用合同约定的，人民法院应予支持。
总结：上班迟到1分钟是否要扣全勤奖，并非一个简单的是非问题，而是需要综合考虑劳动合同、规章制度的内容及其合法性、合理性等多个因素。用人单位在制定和执行相关规章制度时，应确保规定的合理性和合法性，而员工在面临扣奖情况时也应积极了解自己的权益并采取相应措施进行维权。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。