结论：劳动合同上约定工资为3200元，而实际发放6600元，剩余部分作为加班费，这种做法是否合法，需分情况讨论。若该约定不违反法律法规的强制性规定，且双方真实意思表示一致，同时实际发放的工资不低于当地最低工资标准，那么这种约定是合法的；反之，则不合法。若不合法，您可以通过协商、投诉或申请劳动仲裁等方式来维权。

详细分析：

1. 合法性分析：

   • 合同自由原则：根据《劳动合同法》的相关规定，劳动合同是劳动者与用人单位确立劳动关系、明确双方权利和义务的协议。在合同中，双方可以就工资、加班费等事项进行约定，只要该约定不违反法律法规的强制性规定，且双方真实意思表示一致，就是有效的。
   • 最低工资标准：根据《劳动法》的规定，用人单位支付劳动者的工资不得低于当地最低工资标准。因此，即使劳动合同中约定了较低的工资，但实际发放的工资（包括加班费）必须不低于当地最低工资标准，否则该约定无效。
   • 加班费计算：加班费是劳动者在超出正常工作时间外工作所应获得的报酬。根据《劳动法》的规定，加班费的计算应基于劳动者的实际工资水平。如果劳动合同中约定的工资远低于实际发放的工资，且将差额部分作为加班费，这种做法可能涉嫌规避法律义务，损害劳动者的合法权益。

2. 维权方式：

   • 协商：首先，您可以尝试与用人单位进行协商，要求用人单位按照实际工资水平支付加班费，并调整劳动合同中的相关条款。
   • 投诉：如果协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉，要求劳动监察部门对用人单位的违法行为进行查处，并责令用人单位支付应得的加班费。
   • 申请劳动仲裁：如果投诉仍未解决问题，您可以向当地劳动仲裁委员会申请劳动仲裁，要求仲裁委员会裁决用人单位支付加班费及可能的赔偿金。在申请劳动仲裁时，您需要提供相关证据，如工资条、劳动合同、加班记录等，以证明您的主张。

建议：

• 在签订劳动合同时，务必仔细阅读合同条款，特别是关于工资、加班费等关键条款，确保自己的合法权益得到保障。
• 保留好与工资、加班费相关的证据，如工资条、银行转账记录、加班记录等，以便在维权时提供有力支持。
• 如果遇到用人单位违法行为，及时采取措施进行维权，不要拖延时间，以免错过最佳维权时机。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。