劳动合同中约定的加班费在一定条件下是合法的，但必须严格遵守相关法律法规的规定。以下是对这一问题的详细分析：
合法性条件
自愿协商：
- 双方必须在平等、自愿的基础上进行协商，确保合同内容真实反映双方的意愿。任何一方不得通过欺诈、胁迫等手段迫使对方接受不合理的加班费约定。
合理计算：
- 加班费的计算必须符合国家规定的标准。具体来说，工作日加班应支付不低于工资150%的加班费，休息日加班且不能安排补休的应支付不低于工资200%的加班费，法定休假日加班则应支付不低于工资300%的加班费。如果劳动合同中约定的加班费低于这些标准，那么该约定将被视为无效。
明确告知：
- 用人单位必须向劳动者明确说明工资构成中包含加班费的情况，包括加班费的计算方式、支付周期等，以避免事后产生争议。
法律风险
补足差额：
- 如果用人单位未依法支付加班费，或者约定的加班费低于国家规定的标准，劳动者有权要求用人单位补足差额部分。这是劳动者的合法权益，用人单位必须予以尊重并履行。
举证责任：
- 在发生劳动争议时，用人单位需要承担举证责任，证明其已经按照法律规定支付了加班费。如果无法提供充分证据，如工资条、考勤记录等，用人单位可能面临败诉的风险。
实践中的注意事项
合同条款清晰：
- 在劳动合同中应明确约定工资构成、加班费计算方式及支付时间等关键条款。避免使用模糊不清的语言，以免导致后续纠纷。例如，可以明确约定“月工资为XX元，其中包含每月可能产生的加班费，加班费按照国家规定标准计算并支付”。
保留证据：
- 用人单位应妥善保存考勤记录、工资支付凭证等证据材料。这些证据在发生劳动争议时将起到至关重要的作用，有助于证明用人单位已经依法支付了加班费。
合规操作：
- 用人单位应严格遵守国家关于工作时间和休息休假的规定，合理安排劳动者的工作时间和休息时间。避免过度加班，确保劳动者的身心健康和合法权益。
实例说明
假设某公司与员工签订的劳动合同中明确约定：“月工资为6000元，其中包含每月可能产生的加班费，加班费按照国家规定标准计算并支付。”若该员工在某月加班了10小时（其中工作日加班5小时，休息日加班5小时且未安排补休），则公司应按照约定支付加班费。具体计算如下：
- 工作日加班费：假设员工小时工资为X元，则工作日加班费为5X * 150% = 7.5X元。
- 休息日加班费：休息日加班费为5X * 200% = 10X元。
- 总加班费：7.5X + 10X = 17.5X元。
如果17.5X元小于或等于月工资中已包含的加班费部分（即6000元中除去正常工作时间工资后的部分），则公司无需额外支付加班费；如果17.5X元大于该部分，则公司需补足差额。
综上所述，劳动合同中约定的加班费在符合上述条件的情况下是合法的。但为了确保合法性和避免纠纷，建议用人单位在与劳动者约定加班费时务必谨慎操作，并咨询专业律师的意见。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。