核心结论：五年全民制合同工上班两年，这两年是算工龄的。以下从不同角度进行详细分析：
工龄的定义与计算：
- 工龄，通常指的是职工以工资收入为生活资料的全部或主要来源的工作时间。在计算工龄时，一般遵循的是实际工作年限的原则，即职工实际在单位工作的时间。
- 对于全民制合同工，其工龄的计算同样遵循这一原则。只要职工与用人单位签订了劳动合同，并实际在单位工作，那么这段时间就应当计入工龄。
全民制合同工的特点：
- 全民制合同工是计划经济时期的一种用工形式，其特点在于职工与用人单位之间建立了长期的、稳定的劳动关系。
- 在这种用工形式下，职工的工资、福利等通常由国家或单位统一规定，且职工享有相对稳定的职业保障。
- 因此，对于全民制合同工而言，其实际在单位工作的时间，无论长短，都应当计入工龄。
相关法律法规的支持：
- 虽然具体的法律法规可能因地区和时代而异，但一般来说，我国劳动法律法规都明确规定了工龄的计算原则和方法。
- 在这些法律法规中，通常都会强调实际工作年限的重要性，并明确规定职工在单位实际工作的时间应当计入工龄。
- 对于全民制合同工而言，由于其与用人单位之间建立了长期的、稳定的劳动关系，因此其工龄的计算也应当遵循这一原则。
实际应用中的注意事项：
- 在实际应用中，计算工龄时可能会遇到一些特殊情况，如职工因病休假、停薪留职等。在这些情况下，工龄的计算可能会受到一定影响。
- 但对于全民制合同工上班两年的情况而言，只要职工实际在单位工作了两年，且没有因特殊原因中断工作，那么这两年就应当毫无争议地计入工龄。
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