结论：老板在清算工资后解除劳动合同是否合法，需根据解除的具体原因和程序来判断，不能一概而论。以下从不同角度进行分析：
一、合法解除劳动合同的情形
员工存在过错：
- 如果员工存在严重违反公司规章制度、严重失职或营私舞弊给公司造成重大损害、被依法追究刑事责任等情形，老板在清算工资后解除劳动合同是合法的。这种情况下，老板无需支付经济补偿金。
协商一致解除：
- 如果老板与员工就解除劳动合同达成一致意见，并签订了书面协议，那么老板在清算工资后解除劳动合同也是合法的。根据《劳动合同法》的规定，双方协商一致解除劳动合同的，老板需要按照员工的工作年限支付经济补偿金（每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付）。
经济性裁员：
- 在某些特定情况下，如公司经营状况发生严重困难、转产或重大技术革新等，老板可能需要进行经济性裁员。如果老板按照法定程序进行了经济性裁员，并在清算工资后解除劳动合同，那么这也是合法的。经济性裁员时，老板同样需要按照员工的工作年限支付经济补偿金。
二、非法解除劳动合同的情形
无合法理由解除：
- 如果老板没有合法理由，如员工没有过错、未协商一致、不符合经济性裁员条件等，就单方面在清算工资后解除劳动合同，那么这是非法的。员工有权要求老板继续履行劳动合同或者支付赔偿金（赔偿金是经济补偿金的两倍）。
未履行法定程序：
- 即使老板有合法理由解除劳动合同，但如果未按照法定程序进行，如未提前通知员工、未听取员工意见、未向劳动行政部门报告等，那么解除劳动合同的行为也可能被认定为非法。
三、建议与注意事项
保留证据：
- 员工在面临老板解除劳动合同的情况时，应尽可能保留相关证据，如劳动合同、工资单、解除劳动合同通知书、与老板的沟通记录等。这些证据将有助于员工在后续维权过程中证明自己的权益。
及时咨询：
- 如果员工对老板解除劳动合同的行为有疑问或不满，应及时向我咨询。我可以根据具体情况为员工提供专业的法律意见和帮助。
注意时效：
- 员工在维护自己权益时，应注意相关时效规定。例如，申请劳动仲裁的时效期间为一年，从员工知道或应当知道其权益被侵害之日起计算。
举例：假设员工小张在公司工作三年，因公司经营状况不佳被经济性裁员。老板在清算工资后解除了与小张的劳动合同，并按照法定程序支付了经济补偿金。这种情况下，老板的解除行为是合法的。但如果老板没有提前通知小张、未听取小张意见或未向劳动行政部门报告就单方面解除劳动合同，那么解除行为就是非法的。
总结：老板在清算工资后解除劳动合同是否合法，取决于解除的具体原因和程序。员工在面临这种情况时，应保留相关证据、及时咨询并注意时效规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我提问。